编号: | 223957 |
中文名称: | 荧光素标记的caspase-1 inhibitor |
单字母: | 5FAM-YVAD-FMK |
三字母: | 5FAM N端标记5-FAM -TyrL-酪氨酸:tyrosine。系统命名为(2S)-氨基-3-(4-羟基苯基)丙酸。是编码氨基酸。符号:Y,Tyr。 -ValL-缬氨酸:valine。系统命名为(2S)-氨基-3-甲基丁酸。是编码氨基酸。是哺乳动物的必需氨基酸。符号:V,Val。在某些放线菌素如缬霉素中存在 D-缬氨酸。 -Ala丙氨酸:alanine。L-丙氨酸的系统命名为(2S)-氨基丙酸,是编码氨基酸,也叫L-α-丙氨酸。符号:A,Ala。D-丙氨酸存在于多种细菌细胞壁的糖肽中。β-丙氨酸是维生素泛酸和辅酶A的组分。 -AspL-天冬氨酸:aspartic acid。系统命名为(2S)-氨基-丁二酸。是编码氨基酸,又是神经递质。符号:D,Asp。D-天冬氨酸存在于多种细菌的细胞壁和短杆菌肽A中。 -FMKC端氟甲基酮修饰 |
氨基酸个数: | 4 |
分子式: | C43H41O13N4F1 |
平均分子量: | 840.8 |
精确分子量: | 840.27 |
等电点(PI): | 7.01 |
pH=7.0时的净电荷数: | - |
平均亲水性: | -0.6 |
疏水性值: | 0.4 |
外观与性状: | 粉末状固体 |
消光系数: | 1490 |
来源: | 人工化学合成,仅限科学研究使用,不得用于人体。 |
储存条件: | 负80℃至负20℃ |
标签: | FAM、FITC修饰肽 FMK修饰肽 |
荧光素标记的半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶抑制剂caspase-1特异性(FLICA)检测分析
多肽荧光标记由于没有放射性,实验操作简单。因此,目前在生物学研究中多肽荧光标记应用非常广泛,多肽荧光标记方法与荧光试剂的结构有关系,对于有游离羧基的采用的方法与接多肽反应相同,也采用HBTU/HOBt/DIEA方法连接。 在N端标记FITC的多肽需经历环化作用来形成荧光素,通常会伴有最后一个氨基酸的去除,但当有一个间隔器如氨基己酸,或者是通过非酸性环境将目的多肽从树脂上切下来时,这种情况可避免在切割的过程中被TFA切割掉。
人们利用利用荧光标记的多肽来检测目标蛋白的活性,并将 其发展的高通量活性筛选方法应用于疾病治疗靶点蛋白的药物筛选和药物开发(例如,各种激 酶、磷酸酶、肽酶等)。
专肽生物能够提供技术成熟的各种荧光标记多肽。
下面是一些常见的多肽修饰荧光物质结构:
FITC标记
FITC(异硫氰酸荧光素)具有比较高的活性,我们公司可以通过两种方式将FITC标记于多肽 上:(1) 将FITC标记于赖氨酸(Lys)或被选择性地脱保护的鸟氨酸(ornithine)侧链氨基 上;(2) 将FITC标记于多肽N端氨基。
当在N端标记时,建议在最后一个氨基和由异硫氰酸酯与氨基反应产生的硫脲键之间引入 烷基间隔器(alkyl spacer),如氨基己酸(Ahx)。链接切割需要酸性环境,在N端标记FITC 的多肽需经历环化作用来形成荧光素,通常会伴有最后一个氨基酸的去除,但当有一个间隔器 如氨基己酸,或者是通过非酸性环境将目的肽从树脂上切下来时,这种情况可避免。空间位阻 被认为是在荧光染料前使用Ahx的主要原因,而不是为什么FITC不能直接偶联在多肽上的原因。
Ahx或b-Ala均可作为间隔器用于FITC标记的多肽上。
荧光修饰中文名称 | N端 | N端带有linker |
生物素标记多肽 | Biotin- | Biotin-Ahx- |
异硫氰酸荧光素 | FITC- | FITC-Ahx- |
5-羧基荧光素 | 5-FAM- | 5-FAM-Ahx- |
丹磺酰荧光素 | Dansyl- | Dansyl-Ahx- |
5-羧基四甲基罗丹明 | TMR- (TAMRA-) | TMR-Ahx- (TAMRA-Ahx-) |
多肽N端 | 多肽序列中间 | N端带有linker |
生物素标记多肽 | Biotin- | 多肽C端 |
Lys(Biotin)- | -Lys(Biotin)-- | -Lys(Biotin) |
Lys(FITC)- | -Lys(FITC)- | -Lys(FITC) |
Lys(5-FAM)- | -Lys(5-FAM)- | -Lys(5-FAM) |
Lys(Dansyl)- | -Lys(Dansyl)- | -Lys(Dansyl) |
Lys(TMR)- | -Lys(TMR)- | -Lys(TMR) |
Lys(Dnp)- | -Lys(Dnp)- | -Lys(Dnp) |
专肽常做的荧光物质的激发光波长和发射光波长。可供参考选择:
荧光基团 | Ex(nm) | Em(nm) | 荧光基团 | Ex(nm) | Em(nm) |
羟基香豆素 | 325 | 386 | R-phycoerythrin (PE) (489) | 565 | 578 |
丹磺酰氯 | 340 | 578 | Rhodamine Red-X | 560 | 580 |
AMC | 345 | 445 | Tamara | 565 | 580 |
甲氧基香豆素 | 360 | 410 | Alexa fluor 555 | 556 | 573 |
Alexa fluor 系列 | 345 | 442 | Alexa fluor 546 | 556 | 573 |
氨基香豆素 | 350 | 445 | Rox | 575 | 602 |
Dabcyl | 453 | - | Alexa fluor 568 | 578 | 603 |
Cy2 | 490 | 510 | Texas Red | 589 | 615 |
FAM | 495 | 517 | Alexa fluor 594 | 590 | 617 |
Alexa fluor 488 | 494 | 517 | Alexa fluor | 621 | 639 |
FITC | 495 | 519 | Alexa fluor 633 | 650 | 668 |
Alexa fluor 430 | 430 | 545 | Cy5 (625) | 650 | 670 |
5-FAM | 492 | 518 | Alexa fluor 660 | 663 | 690 |
Alexa fluor 532 | 530 | 530 | Cy5.5 | 675 | 694 |
HEX | 535 | 556 | TruRed | 490; 675 | 695 |
5-TAMRA | 542 | 568 | Alexa fluor 680 | 679 | 702 |
Cy3 | 550 | 570 | Cy7 | 743 | 767 |
TRITC | 547 | 572 | Cy3.5 | 581 | 596 |
DOI | 名称 | |
---|---|---|
10.1007/s00109-015-1275-1 | Light induces NLRP3 inflammasome activation in retinal pigment epithelial cells via lipofuscin-mediated photooxidative damage | 下载 |