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OD1 是一种蜘蛛源多肽,含有稳定的二硫键骨架,适用于离子通道相互作用研究。其紧凑结构支持高分辨率生物物理表征。疏水表面有助于膜结合行为。研究人员将其用于毒素进化与结构分析。
编号:637417
CAS号:
单字母:H2N-GVRDAYIADDKNCVYTCASNGYCNTECTKNGAESGYCQWIGRYGNACWCIKLPDEVPIRIPGKCR-CONH2(Disulfide Bridge:C13-C64 & C17-C37 & C23-C47 & C27-C49)
| 编号: | 637417 |
| 中文名称: | OD1 |
| 单字母: | H2N-GVRDAYIADDKNCVYTCASNGYCNTECTKNGAESGYCQWIGRYGNACWCIKLPDEVPIRIPGKCR-CONH2(Disulfide Bridge:C13-C64 & C17-C37 & C23-C47 & C27-C49) |
| 三字母: | H2N-Gly-Val-Arg-Asp-Ala-Tyr-Ile-Ala-Asp-Asp-Lys-Asn-Cys-Val-Tyr-Thr-Cys-Ala-Ser-Asn-Gly-Tyr-Cys-Asn-Thr-Glu-Cys-Thr-Lys-Asn-Gly-Ala-Glu-Ser-Gly-Tyr-Cys-Gln-Trp-Ile-Gly-Arg-Tyr-Gly-Asn-Ala-Cys-Trp-Cys-Ile-Lys-Leu-Pro-Asp-Glu-Val-Pro-Ile-Arg-Ile-Pro-Gly-Lys-Cys-Arg-CONH2(Disulfide Bridge:Cys13-Cys64 & Cys17-Cys37 & Cys23-Cys47 & Cys27-Cys49) |
| 氨基酸个数: | 65 |
| 分子式: | C308H466N90O95S8 |
| 平均分子量: | 7206.06 |
| 精确分子量: | 7201.22 |
| 等电点(PI): | 10.76 |
| pH=7.0时的净电荷数: | 14.73 |
| 平均亲水性: | -0.072727272727273 |
| 疏水性值: | -0.44 |
| 消光系数: | 18450 |
| 标签: | 二硫键环肽 |
OD1 是一种蜘蛛源多肽,含有稳定的二硫键骨架,适用于离子通道相互作用研究。其紧凑结构支持高分辨率生物物理表征。疏水表面有助于膜结合行为。研究人员将其用于毒素进化与结构分析。
OD1 is a spider-derived peptide containing a stabilized disulfide framework suitable for ion-channel interaction studies. Its compact structure supports high-resolution biophysical characterization. Hydrophobic surfaces contribute to membrane-binding behavior. Researchers apply it in toxin-evolution and structural analyses.
二硫键广泛存在与蛋白结构中,对稳定蛋白结构具有非常重要的意义,二硫键一般是通过序列中的2个Cys的巯基,经氧化形成。
形成二硫键的方法很多:空气氧化法,DMSO氧化法,过氧化氢氧化法等。
二硫键的合成过程, 可以通过Ellman检测以及HPLC检测方法对其反应进程进行监测。
如果多肽中只含有1对Cys,那二硫键的形成是简单的。多肽经固相或液相合成,然后在pH8-9的溶液中进行氧化。
当需要形成2对或2对以上的二硫键时,合成过程则相对复杂。尽管二硫键的形成通常是在合成方案的最后阶段完成,但有时引入预先形成的二硫化物是有利于连合或延长肽链的。通常采用的巯基保护基有trt, Acm, Mmt, tBu, Bzl, Mob, Tmob等多种基团。我们分别列出两种以2-Cl树脂和Rink树脂为载体合成的多肽上多对二硫键形成路线:
二硫键反应条件选择
二硫键即为蛋白质或多肽分子中两个不同位点Cys的巯基(-SH)被氧化形成的S-S共价键。 一条肽链上不同位置的氨基酸之间形成的二硫键,可以将肽链折叠成特定的空间结构。多肽分 子通常分子量较大,空间结构复杂,结构中形成二硫键时要求两个半胱氨酸在空间距离上接近。 此外,多肽结构中还原态的巯基化学性质活泼,容易发生其他的副反应,而且肽链上其他侧链 也可能会发生一系列修饰,因此,肽链进行修饰所选取的氧化剂和氧化条件是反应的关键因素, 反应机理也比较复杂,既可能是自由基反应,也可能是离子反应。
反应条件有多种选择,比如空气氧化,DMSO氧化等温和的氧化过程,也可以采用H2O2,I2, 汞盐等激烈的反应条件。
空气氧化法: 空气氧化法形成二硫键是多肽合成中最经典的方法,通常是将巯基处于还原态的多肽溶于水中,在近中性或弱碱性条件下(PH值6.5-10),反应24小时以上。为了降低分子之间二硫键形成的可能,该方法通常需要在低浓度条件下进行。
碘氧化法:将多肽溶于25%的甲醇水溶液或30%的醋酸水溶液中,逐滴滴加10-15mol/L的碘进行氧化,反应15-40min。当肽链中含有对碘比较敏感的Tyr、Trp、Met和His的残基时,氧化条件要控制的更精确,氧化完后,立即加入维生素C或硫代硫酸钠除去过量的碘。 当序列中有两对或多对二硫键需要成环时,通常有两种情况:
自然随机成环: 序列中的Cys之间随机成环,与一对二硫键成环条件相似;
定点成环: 定点成环即序列中的Cys按照设计要求形成二硫键,反应过程相对复杂。在 固相合成多肽之前,需要提前设计几对二硫键形成的顺序和方法路线,选择不同的侧链 巯基保护基,利用其性质差异,分步氧化形成两对或多对二硫键。 通常采用的巯基保护 基有trt, Acm, Mmt, tBu, Bzl, Mob, Tmob等多种基团。





