caspase-1抑制剂Z-VAD-FMK的生物素类似物。
编号：120237
CAS号：2243207-07-8
单字母：Biotinyl-VAd-FMK
| 编号: | 120237 |
| 中文名称: | 三肽Biotinyl-Val-Ala-DL-Asp-fluoromethylketone |
| 英文名: | Biotinyl-Val-Ala-DL-Asp-fluoromethylketone |
| CAS号: | 2243207-07-8 |
| 单字母: | Biotinyl-VAd-FMK |
| 三字母: | Biotinyl N端生物素标记 -ValL-缬氨酸：valine。系统命名为(2S)-氨基-3-甲基丁酸。是编码氨基酸。是哺乳动物的必需氨基酸。符号：V，Val。在某些放线菌素如缬霉素中存在 D-缬氨酸。 -Ala丙氨酸：alanine。L-丙氨酸的系统命名为(2S)-氨基丙酸，是编码氨基酸，也叫L-α-丙氨酸。符号：A，Ala。D-丙氨酸存在于多种细菌细胞壁的糖肽中。β-丙氨酸是维生素泛酸和辅酶A的组分。 -DAspD型天冬氨酸 -FMKC端氟甲基酮修饰 |
| 氨基酸个数: | 3 |
| 分子式: | C23H36N5O7S1F1 |
| 平均分子量: | 545.62 |
| 精确分子量: | 545.23 |
| 等电点(PI): | - |
| pH=7.0时的净电荷数: | -1 |
| 平均亲水性: | 0.33333333333333 |
| 疏水性值: | 0.83 |
| 消光系数: | - |
| 来源: | 人工化学合成，仅限科学研究使用，不得用于人体。 |
| 储存条件: | 负80℃至负20℃ |
| 标签: | 生物素标记肽(Biotinyl) D型氨基酸肽 三肽 FMK修饰肽 |
Biotinylated analog of the caspase-1 inhibitor Z-VAD-FMK.
专肽生物合成用于蛋白质-蛋白质相互作用研究的生物素化肽。尽管生物素可以在 N 端或 C 端引入（通过赖氨酸残基），但我们建议使用 N 端修饰，因为它成本低、成功率高、周转时间短且易于操作。因为多肽合成是从 C 端到 N 端合成的，因此，N 端修饰是 SPPS步骤的最后一步，不需要额外的特定缩合步骤。相比之下，C 端修饰需要额外的步骤，并且通常更复杂。当然，原则上生物素可以定位在任何地方。
生物素可以通过多种不同的接头或间隔物与肽分离。尽管如此，还是建议包含一个灵活的间隔物，例如 Ahx（一个 6 碳接头），以使生物素标签更加稳定或灵活。
专肽生物在 N 端或 C 端提供生物素化：生物素-N 端、赖氨酸-生物素-肽中间和赖氨酸-生物素-C 端。
专肽生物还可以使用 Ahx 接头或长碳 (LC) 接头提供生物素化：生物素-Ahx-N 末端、Lys-Ahx-生物素-肽中间、Lys-Ahx-生物素-C-末端。
（生物素结构）
示例：
GRGDS在N端和C端标记生物素的结构展示。
1、GRGDS在N端标记生物素，不增加Ahx 接头
2、GRGDS在N端标记生物素，增加一个Ahx 接头
3、GRGDS在C端标记生物素，不增加Ahx 接头
4、GRGDS在C端标记生物素，增加一个Ahx 接头。
很多蛋白在细胞中非常容易被降解，或被标记，进而被选择性地破坏。但含有部分D型氨基酸的多肽则显示了很强的抵抗蛋白酶降解能力。
T.Yang et al., Cancer Res., 62, 2583 (2002)；http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=PubMed&dopt=Citation&list_uids=11980653
