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N端氨基：N-terminal amino group。在肽或多肽链中含有游离a-氨基的氨基酸一端。在表示氨基酸序列时，通常将N端放在肽链的左边。

L-甲硫氨酸：methionine又称“蛋氨酸”。系统命名为(2S)-氨基-4-甲硫基丁酸。是编码氨基酸。是哺乳动物的必需氨基酸。符号：M，Met。

侧链Pbf保护的精氨酸

L-色氨酸：tryptophan[e]。系统命名为(2S)-氨基-3-(3-吲哚基)丙酸。是编码氨基酸，哺乳动物的必需氨基酸。符号：W，Trp。某些抗菌素中含有 D-色氨酸。

侧链Trt保护的谷氨酰胺

侧链OtBu保护的谷氨酸

L-甲硫氨酸：methionine又称“蛋氨酸”。系统命名为(2S)-氨基-4-甲硫基丁酸。是编码氨基酸。是哺乳动物的必需氨基酸。符号：M，Met。

甘氨酸：glycine。系统命名为 2-氨基乙酸。是编码氨基酸中没有旋光性的最简单的氨基酸，因具有甜味而得名。符号：G，Gly。

侧链tBu保护的酪氨酸，叔丁基醚保护基团在Fmoc-SPPS中常用于保护丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸和羟脯氨酸的含羟基侧链，并可用强酸如三氟乙酸（TFA）去除。

L-异亮氨酸：isoleucine。系统命名为(2S)-氨基-(3R)-甲基戊酸。是编码氨基酸。有两个手性碳原子，是哺乳动物的必需氨基酸。符号:I，Ile。

L-苯丙氨酸：phenylalanine。系统命名为(2S)-氨基-3-苯基丙酸。是编码氨基酸。是哺乳动物的必需氨基酸。符号：F，Phe。

侧链tBu保护的酪氨酸，叔丁基醚保护基团在Fmoc-SPPS中常用于保护丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸和羟脯氨酸的含羟基侧链，并可用强酸如三氟乙酸（TFA）去除。

L-脯氨酸：proline。系统命名为吡咯烷-(2S)-羧酸。为亚氨基酸。是编码氨基酸。在肽链中有特殊作用，如易形成顺式的肽键等。符号：P，Pro。

侧链Pbf保护的精氨酸

侧链Boc保护的赖氨酸；叔丁氧羰基或叔丁氧羰基（Boc）是胺的保护基团。Boc基团可用强酸去除，如用三氟乙酸在二氯甲烷中去除，或用HCl在甲醇中去除。

L-亮氨酸：leucine。系统命名为(2S)-氨基-4-甲基戊酸。是编码氨基酸。是哺乳动物的必需氨基酸。符号：L，Leu。

侧链Pbf保护的精氨酸

C端羧基：C-terminal carboxyl group。在肽或多肽链中含有游离羧基的氨基酸一端。在表示氨基酸序列时，通常将C端放在肽链的右边。