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1166966-93-3,DABCYL修饰肽:DABCYL-Val-Asp-Tyr(PO3H2)-Val-Pro-Met-Le,DABCYL-Val-Asp-Tyr(PO3H2)-Val-Pro-Met-Leu-Asp-Cys-NH2,Dabcyl-VD-pTyr-VPMLDC-NH2,杭州专肽生物的产品

DABCYL修饰肽:DABCYL-Val-Asp-Tyr(PO3H2)-Val-Pro-Met-Le

编号:132852

CAS号:1166966-93-3

单字母:Dabcyl-VD-pTyr-VPMLDC-CONH2

纠错
  • 编号:132852
    中文名称:DABCYL修饰肽:DABCYL-Val-Asp-Tyr(PO3H2)-Val-Pro-Met-Le
    英文名:DABCYL-Val-Asp-Tyr(PO3H2)-Val-Pro-Met-Leu-Asp-Cys-
    CAS号:1166966-93-3
    单字母:Dabcyl-VD-pTyr-VPMLDC-CONH2
    三字母:DABCYL

    N端Dabcyl标记,4-(4-二甲氨基苯基偶氮)苯甲酰基(Dabcyl)是一种发色团,常与荧光团(如EDANS)结合用作猝灭剂。Dabcyl/EDANS FRET(荧光共振能量转移)对的福斯特半径为3.3纳米。

    -Val

    L-缬氨酸:valine。系统命名为(2S)-氨基-3-甲基丁酸。是编码氨基酸。是哺乳动物的必需氨基酸。符号:V,Val。在某些放线菌素如缬霉素中存在 D-缬氨酸。

    -Asp

    L-天冬氨酸:aspartic acid。系统命名为(2S)-氨基-丁二酸。是编码氨基酸,又是神经递质。符号:D,Asp。D-天冬氨酸存在于多种细菌的细胞壁和短杆菌肽A中。

    -Tyr(PO3H2)

    磷酸化酪氨酸

    -Val

    L-缬氨酸:valine。系统命名为(2S)-氨基-3-甲基丁酸。是编码氨基酸。是哺乳动物的必需氨基酸。符号:V,Val。在某些放线菌素如缬霉素中存在 D-缬氨酸。

    -Pro

    L-脯氨酸:proline。系统命名为吡咯烷-(2S)-羧酸。为亚氨基酸。是编码氨基酸。在肽链中有特殊作用,如易形成顺式的肽键等。符号:P,Pro。

    -Met

    L-甲硫氨酸:methionine又称“蛋氨酸”。系统命名为(2S)-氨基-4-甲硫基丁酸。是编码氨基酸。是哺乳动物的必需氨基酸。符号:M,Met。

    -Leu

    L-亮氨酸:leucine。系统命名为(2S)-氨基-4-甲基戊酸。是编码氨基酸。是哺乳动物的必需氨基酸。符号:L,Leu。

    -Asp

    L-天冬氨酸:aspartic acid。系统命名为(2S)-氨基-丁二酸。是编码氨基酸,又是神经递质。符号:D,Asp。D-天冬氨酸存在于多种细菌的细胞壁和短杆菌肽A中。

    -Cys

    半胱氨酸:cysteine。L-半胱氨酸的系统命名为(2R)-氨基-3-巯基丙酸,是编码氨基酸。符号:C,Cys。D-半胱氨酸存在于萤火虫的萤光素酶中。

    -CONH2

    C端酰胺化

    氨基酸个数:9
    分子式:C61H86N13O18P1S2
    平均分子量:1384.52
    精确分子量:1383.54
    等电点(PI):3.9
    pH=7.0时的净电荷数:-1.03
    平均亲水性:-0.15714285714286
    疏水性值:1
    外观与性状:白色粉末状固体
    消光系数:1490
    来源:人工化学合成,仅限科学研究使用,不得用于人体。
    纯度:95%、98%
    盐体系:可选TFA、HAc、HCl或其它
    储存条件:负80℃至负20℃
    标签:磷酸化修饰肽    DABCYL标记肽    含Cys多肽   

  • 磷酸肽的合成
    在生命过程中发挥重要作用,磷酸化的位置在多肽上的Tyr、Ser,Thr,。目前磷酸肽合成一般都采用磷酸化氨基酸,目前使用的都是单苄基磷酸化氨基酸。磷酸化氨基酸的连接一般采用HBTU/HOBt/DIEA方法,但是目前采用该方法合成磷酸化多肽也有缺点,特别是在合成多磷酸化多肽或氨基酸较长的多肽的时候,连接效率低,最后产品纯度很低,对于这种磷酸化多肽,我们考虑采用后磷酸化方法,其合成过程就是在多肽合成结束后,选择性脱去要标记的氨基酸的侧链保护基,对于Tyr,Thr可以直接使用侧链不保护的氨基酸进行反应,而Ser可以采用Fmoc-Ser(trt),在1% TFA/DCM条件下可以定量的脱除。后磷酸化,采用双苄基亚磷酰胺,四氮唑生成亚磷酰胺四唑活性中间体,连接到羟基上,随后在过氧酸下氧化生成磷酰基,完成反应。

    目前,多肽的磷酸化修饰方法主要有两种:

    (1)将适当保护的磷酸化氨基酸直接引入到多肽序列中;

    (2)多肽序列在树脂上合成完后,再对其中的Ser、Tyr或Thr的侧链羟基进行磷酸化。
     

    1)将适当保护的磷酸化氨基酸直接引入到多肽序列中:

    即事先将需要磷酸化的氨基酸(Thr,Ser或Tyr)磷酸化并适当保护,然后按照正常SPPS 合成流程将磷酸化单体缩合到多肽指定位点。这种方法操作简便,已经成为多肽单位点 磷酸化修饰的主要方法。



     

    2)多肽序列在树脂上合成完后,再对其中的Ser、Tyr或Thr的侧链羟基进行磷酸化:

            采用将磷酸化单体缩合到多肽中的方法进行磷酸化修饰时,磷酸化的氨基酸由于侧链修 饰的较大基团产生的位阻而导致难以与肽链缩合,并且之后的氨基酸引入都会比较困难, 尤其在含有多个磷酸化位点修饰时,合成将变得异常困难,并且最终产物成分复杂,难 以分离,产率极低。
            因此,当肽链中多个位点进行磷酸化时,可以考虑采用将多肽序列 在树脂上合成完后,再对其中的Ser、Tyr或Thr的侧链羟基进行磷酸化:其合成过程主要 就是在多肽合成结束之后,选择性的脱去要标记氨基酸的侧链保护基,对于Tyr,Thr可 以直接使用侧链不保护的氨基酸进行反应。

            侧链保护基在1%TFA/DCM条件下可以定量的脱 除。采用这种方法时,可以采用双苄基亚磷酰胺,四氮唑生成亚磷酰胺四唑活性中间体, 连接到羟基上,然后在过氧酸条件下氧化生成磷酰基,完成反应。

    磷酸肽的的介绍

    在所有的PTM中,磷酸化是最丰富和最重要的修饰之一。磷酸基团是一个高度带负电的分子,在磷原子周围有一个四面体结构。磷酸化多肽主要指肽链中的Ser、Tyr和Thr 残基的侧链羟基被修饰成酸式磷酸酯多肽。许多激素均是通过提高丝氨酸(Ser)或苏氨酸(Thr)残基的磷酸化状态来调节特异性酶的活性。磷酸化与人类疾病高度相关。例如,tau、α-synuclein和huntingtin的过度/多重磷酸化与人类疾病高度相关,聚集磷酸化也爆发神经退行性疾病的主要原因之一,例如阿尔茨海默氏病、帕金森氏病和亨廷顿氏病。目前,对磷酸化氨基酸的主要研究集中在羟基磷酸单酯型磷酸化氨基酸(O-磷酸化氨基酸),即磷酸化丝氨酸,磷酸化苏氨酸,磷酸化酪氨酸。

    专肽生物生物为客户提供pSer、pTyr、pThr和D-pSer、D-pTyr、D-pThr的磷酸化修饰服务,也可以进行二、三、四、五个磷酸化位点修饰的高质量多肽的合成。

    DABCYL标记说明

    4-(4-二甲氨基苯基偶氮)苯甲酰基(Dabcyl)是一种发色团,常与荧光团(如EDANS)结合用作猝灭剂。Dabcyl/EDANS FRET(荧光共振能量转移)对的福斯特半径为3.3纳米。

    4-(4-Dimethylaminophenylazo)benzoyl (Dabcyl) is a chromophor often used as a quencher in conjunction with a fluorophore (e.g., EDANS). Dabcyl/EDANS FRET pair have a Forster radius of 3.3 nm.

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    5-[(2-Aminoethyl)amino]naphthalene-1-sulfonyl (EDANS) is fluorophor with an excitation at 340 nm  and emission of 490 nm . EDANS is often paired together with acceptors like dabcyl for FRET experiements.
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  • 多肽DABCYL-Val-Asp-Tyr(PO3H2)-Val-Pro-Met-Leu-Asp-Cys-NH2的合成步骤:

    1、合成MBHA树脂:取若干克MBHA树脂(如初始取代度为0.5mmol/g)和1倍树脂摩尔量的Fmoc-Linker-OH加入到反应器中,加入DMF,搅拌使氨基酸完全溶解。再加入树脂2倍量的DIEPA,搅拌混合均匀。再加入树脂0.95倍量的HBTU,搅拌混合均匀。反应3-4小时后,用DMF洗涤3次。用2倍树脂体积的10%乙酸酐/DMF 进行封端30分钟。然后再用DMF洗涤3次,甲醇洗涤2次,DCM洗涤2次,再用甲醇洗涤2次。真空干燥12小时以上,得到干燥的树脂{Fmoc-Linker-MHBA Resin},测定取代度。这里测得取代度为 0.3mmol/g。结构如下图:

    2、脱Fmoc:取2.08g的上述树脂,用DCM或DMF溶胀20分钟。用DMF洗涤2遍。加3倍树脂体积的20%Pip/DMF溶液,鼓氮气30分钟,然后2倍树脂体积的DMF 洗涤5次。得到 H2N-Linker-MBHA Resin 。(此步骤脱除Fmoc基团,茚三酮检测为蓝色,Pip为哌啶)。结构图如下:

    3、缩合:取1.87mmol Fmoc-Cys(Trt)-OH 氨基酸,加入到上述树脂里,加适当DMF溶解氨基酸,再依次加入3.74mmol DIPEA,1.78mmol HBTU。反应30分钟后,取小样洗涤,茚三酮检测为无色。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂。(洗涤树脂,去掉残留溶剂,为下一步反应做准备)。得到Fmoc-Cys(Trt)-Linker-MBHA Resin。氨基酸:DIPEA:HBTU:树脂=3:6:2.85:1(摩尔比)。结构图如下:

    4、依次循环步骤二、步骤三,依次得到

    H2N-Cys(Trt)-Linker-MBHA Resin

    Fmoc-Asp(OtBu)-Cys(Trt)-Linker-MBHA Resin

    H2N-Asp(OtBu)-Cys(Trt)-Linker-MBHA Resin

    Fmoc-Leu-Asp(OtBu)-Cys(Trt)-Linker-MBHA Resin

    H2N-Leu-Asp(OtBu)-Cys(Trt)-Linker-MBHA Resin

    Fmoc-Met-Leu-Asp(OtBu)-Cys(Trt)-Linker-MBHA Resin

    H2N-Met-Leu-Asp(OtBu)-Cys(Trt)-Linker-MBHA Resin

    Fmoc-Pro-Met-Leu-Asp(OtBu)-Cys(Trt)-Linker-MBHA Resin

    H2N-Pro-Met-Leu-Asp(OtBu)-Cys(Trt)-Linker-MBHA Resin

    Fmoc-Val-Pro-Met-Leu-Asp(OtBu)-Cys(Trt)-Linker-MBHA Resin

    H2N-Val-Pro-Met-Leu-Asp(OtBu)-Cys(Trt)-Linker-MBHA Resin

    Fmoc-Tyr(HPO3Bzl)-Val-Pro-Met-Leu-Asp(OtBu)-Cys(Trt)-Linker-MBHA Resin

    H2N-Tyr(HPO3Bzl)-Val-Pro-Met-Leu-Asp(OtBu)-Cys(Trt)-Linker-MBHA Resin

    Fmoc-Asp(OtBu)-Tyr(HPO3Bzl)-Val-Pro-Met-Leu-Asp(OtBu)-Cys(Trt)-Linker-MBHA Resin

    H2N-Asp(OtBu)-Tyr(HPO3Bzl)-Val-Pro-Met-Leu-Asp(OtBu)-Cys(Trt)-Linker-MBHA Resin

    Fmoc-Val-Asp(OtBu)-Tyr(HPO3Bzl)-Val-Pro-Met-Leu-Asp(OtBu)-Cys(Trt)-Linker-MBHA Resin

    以上中间结构,均可在专肽生物多肽计算器-多肽结构计算器中,一键画出。

    最后再经过步骤二得到 H2N-Val-Asp(OtBu)-Tyr(HPO3Bzl)-Val-Pro-Met-Leu-Asp(OtBu)-Cys(Trt)-Linker-MBHA Resin,结构如下:

    5、4-二甲胺偶氮苯-4’-羧酸(DABCYL)反应连接:在上述树脂中,加入适当DMF后,再加入1.87mmol 4-二甲胺偶氮苯-4’-羧酸(DABCYL)到树脂中,再加入3.74mmol DIPEA、1.78mmol HBTU,鼓氮气反应30分钟。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂(洗涤树脂,去掉残留溶剂,为下一步反应做准备)。 得到DABCYL-Val-Asp(OtBu)-Tyr(HPO3Bzl)-Val-Pro-Met-Leu-Asp(OtBu)-Cys(Trt)-Linker-MBHAResin。 结构如下:

    5、切割:6倍树脂体积的切割液(或每1g树脂加8ml左右的切割液),摇床摇晃 2小时,过滤掉树脂,用冰无水乙醚沉淀滤液,并用冰无水乙醚洗涤沉淀物3次,最后将沉淀物放真空干燥釜中,常温干燥24小试,得到粗品DABCYL-Val-Asp-Tyr(PO3H2)-Val-Pro-Met-Leu-Asp-Cys-NH2。结构图见产品结构图。

    切割液选择:1)TFA:H2O=95%:5%

    2)TFA:H2O:TIS=95%:2.5%:2.5%

    3)三氟乙酸:茴香硫醚:1,2-乙二硫醇:苯酚:水=87.5%:5%:2.5%:2.5%:2.5%

    (前两种适合没有容易氧化的氨基酸,例如Trp、Cys、Met。第三种适合几乎所有的序列。)

    6、纯化冻干:使用液相色谱纯化,收集目标峰液体,进行冻干,获得蓬松的粉末状固体多肽。不过这时要取小样复测下纯度 是否目标纯度。

    7、最后总结:

    杭州专肽生物技术有限公司(ALLPEPTIDE https://www.allpeptide.com)主营定制多肽合成业务,提供各类长肽,短肽,环肽,提供各类修饰肽,如:荧光标记修饰(CY3、CY5、CY5.5、CY7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等),功能基团修饰肽(叠氮、炔基、DBCO、DOTA、NOTA等),同位素标记肽(N15、C13),订书肽(Stapled Peptide),脂肪酸修饰肽(Pal、Myr、Ste),磷酸化修饰肽(P-Ser、P-Thr、P-Tyr),环肽(酰胺键环肽、一对或者多对二硫键环),生物素标记肽,PEG修饰肽,甲基化修饰肽

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