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N端氨基：N-terminal amino group。在肽或多肽链中含有游离a-氨基的氨基酸一端。在表示氨基酸序列时，通常将N端放在肽链的左边。

L-天冬氨酸：aspartic acid。系统命名为(2S)-氨基-丁二酸。是编码氨基酸，又是神经递质。符号：D，Asp。D-天冬氨酸存在于多种细菌的细胞壁和短杆菌肽A中。

甘氨酸：glycine。系统命名为 2-氨基乙酸。是编码氨基酸中没有旋光性的最简单的氨基酸，因具有甜味而得名。符号：G，Gly。

L-苏氨酸：threonine。系统命名为(2S)-氨基-(3R)-羟基丁酸。有两个手性中心，是编码氨基酸。是哺乳动物的必需氨基酸。符号：T，Thr。

L-谷氨酸：glutamic acid。系统命名为(2S)-氨基-戊二酸。是编码氨基酸。符号：E，Glu。D-谷氨酸存在于多种细菌的细胞壁和某些细菌杆菌肽中。

L-苏氨酸：threonine。系统命名为(2S)-氨基-(3R)-羟基丁酸。有两个手性中心，是编码氨基酸。是哺乳动物的必需氨基酸。符号：T，Thr。

L-丝氨酸：serine。系统命名为(2S)-氨基-3-羟基丙酸。是编码氨基酸。因可从蚕丝中获得而得名。符号：S，Ser。在丝原蛋白及某些抗菌素中含有 D-丝氨酸。

L-谷氨酸：glutamic acid。系统命名为(2S)-氨基-戊二酸。是编码氨基酸。符号：E，Glu。D-谷氨酸存在于多种细菌的细胞壁和某些细菌杆菌肽中。

鸟氨酸：ornithine。系统命名为(2S)，5-二氨基戊酸。由精氨酸降解脱去尿素而产生，是鸟氨酸循环的起始物质。不直接参与蛋白质生物合成。符号：Orn。

L-丝氨酸：serine。系统命名为(2S)-氨基-3-羟基丙酸。是编码氨基酸。因可从蚕丝中获得而得名。符号：S，Ser。在丝原蛋白及某些抗菌素中含有 D-丝氨酸。

L-精氨酸：arginine。系统命名为(2S)-氨基-5-胍基戊酸。在生理条件下带正电荷，为编码氨基酸。是幼小哺乳动物的必需氨基酸。符号：R，Arg。

鸟氨酸：ornithine。系统命名为(2S)，5-二氨基戊酸。由精氨酸降解脱去尿素而产生，是鸟氨酸循环的起始物质。不直接参与蛋白质生物合成。符号：Orn。

L-精氨酸：arginine。系统命名为(2S)-氨基-5-胍基戊酸。在生理条件下带正电荷，为编码氨基酸。是幼小哺乳动物的必需氨基酸。符号：R，Arg。

L-谷氨酸：glutamic acid。系统命名为(2S)-氨基-戊二酸。是编码氨基酸。符号：E，Glu。D-谷氨酸存在于多种细菌的细胞壁和某些细菌杆菌肽中。

甘氨酸：glycine。系统命名为 2-氨基乙酸。是编码氨基酸中没有旋光性的最简单的氨基酸，因具有甜味而得名。符号：G，Gly。

丙氨酸：alanine。L-丙氨酸的系统命名为(2S)-氨基丙酸，是编码氨基酸，也叫L-α-丙氨酸。符号：A，Ala。D-丙氨酸存在于多种细菌细胞壁的糖肽中。β-丙氨酸是维生素泛酸和辅酶A的组分。

L-精氨酸：arginine。系统命名为(2S)-氨基-5-胍基戊酸。在生理条件下带正电荷，为编码氨基酸。是幼小哺乳动物的必需氨基酸。符号：R，Arg。

鸟氨酸：ornithine。系统命名为(2S)，5-二氨基戊酸。由精氨酸降解脱去尿素而产生，是鸟氨酸循环的起始物质。不直接参与蛋白质生物合成。符号：Orn。

鸟氨酸：ornithine。系统命名为(2S)，5-二氨基戊酸。由精氨酸降解脱去尿素而产生，是鸟氨酸循环的起始物质。不直接参与蛋白质生物合成。符号：Orn。

L-精氨酸：arginine。系统命名为(2S)-氨基-5-胍基戊酸。在生理条件下带正电荷，为编码氨基酸。是幼小哺乳动物的必需氨基酸。符号：R，Arg。

鸟氨酸：ornithine。系统命名为(2S)，5-二氨基戊酸。由精氨酸降解脱去尿素而产生，是鸟氨酸循环的起始物质。不直接参与蛋白质生物合成。符号：Orn。

L-亮氨酸：leucine。系统命名为(2S)-氨基-4-甲基戊酸。是编码氨基酸。是哺乳动物的必需氨基酸。符号：L，Leu。

鸟氨酸：ornithine。系统命名为(2S)，5-二氨基戊酸。由精氨酸降解脱去尿素而产生，是鸟氨酸循环的起始物质。不直接参与蛋白质生物合成。符号：Orn。

甘氨酸：glycine。系统命名为 2-氨基乙酸。是编码氨基酸中没有旋光性的最简单的氨基酸，因具有甜味而得名。符号：G，Gly。

鸟氨酸：ornithine。系统命名为(2S)，5-二氨基戊酸。由精氨酸降解脱去尿素而产生，是鸟氨酸循环的起始物质。不直接参与蛋白质生物合成。符号：Orn。

L-亮氨酸：leucine。系统命名为(2S)-氨基-4-甲基戊酸。是编码氨基酸。是哺乳动物的必需氨基酸。符号：L，Leu。

鸟氨酸：ornithine。系统命名为(2S)，5-二氨基戊酸。由精氨酸降解脱去尿素而产生，是鸟氨酸循环的起始物质。不直接参与蛋白质生物合成。符号：Orn。

甘氨酸：glycine。系统命名为 2-氨基乙酸。是编码氨基酸中没有旋光性的最简单的氨基酸，因具有甜味而得名。符号：G，Gly。

鸟氨酸：ornithine。系统命名为(2S)，5-二氨基戊酸。由精氨酸降解脱去尿素而产生，是鸟氨酸循环的起始物质。不直接参与蛋白质生物合成。符号：Orn。

硒代半胱氨酸：selenocysteine。为半胱氨酸中的硫原子被硒取代后的衍生物，即(2R)-氨基-3-氢硒基-L-丙酸。是近年发现的第21个编码氨基酸。其在信使核糖核酸(mRNA)中的相应密码子为 UGA。符号：U，Sec。

甘氨酸：glycine。系统命名为 2-氨基乙酸。是编码氨基酸中没有旋光性的最简单的氨基酸，因具有甜味而得名。符号：G，Gly。

L-赖氨酸：lysine。系统命名为(2S)-6-二氨基已酸。是编码氨基酸中的碱性氨基酸，哺乳动物的必需氨基酸。在蛋白质中的赖氨酸可以被修饰为多种形式的衍生物。符号：K，Lys。

C端羧基：C-terminal carboxyl group。在肽或多肽链中含有游离羧基的氨基酸一端。在表示氨基酸序列时，通常将C端放在肽链的右边。