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N端Fmoc保护，9-芴甲氧羰基（Fmoc）是伯胺和仲胺的保护基团。在固相肽合成（SPPS）中，它是氨基酸主链的常用保护基，因为它可以很容易地用哌啶去除，而不会干扰树脂和肽之间的酸不稳定连接体。

丙氨酸：alanine。L-丙氨酸的系统命名为(2S)-氨基丙酸，是编码氨基酸，也叫L-α-丙氨酸。符号：A，Ala。D-丙氨酸存在于多种细菌细胞壁的糖肽中。β-丙氨酸是维生素泛酸和辅酶A的组分。

L-酪氨酸：tyrosine。系统命名为(2S)-氨基-3-(4-羟基苯基)丙酸。是编码氨基酸。符号：Y，Tyr。

C端甲酯化修饰，甲酯是最简单的酯类，在溶液合成中作为重要的半永久性C端保护基团。它们可以转化为肽肼，而肽肼是反应性肽叠氮化物的先驱体。叠氮偶联仍是肽溶液合成中片段偶联最常用的方法。