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多肽产品

角蝰毒素S6d、Sarafotoxin S6d,H2N-Cys-Thr-Cys-Lys-Asp-Met-Thr-Asp-Lys-Glu-Cys-Leu-Tyr-Phe-Cys-His-Gln-Asp-Ile-Ile-Trp-COOH,H2N-CTCKDMTDKECLYFCHQDIIW-OH,杭州专肽生物的产品

角蝰毒素S6d、Sarafotoxin S6d (Mouse)

编号:135975

CAS号:

单字母:H2N-CTCKDMTDKECLYFCHQDIIW-OH

纠错
  • 编号:135975
    中文名称:角蝰毒素S6d、Sarafotoxin S6d (Mouse)
    英文名:Sarafotoxin S6d (Mouse)
    单字母:H2N-CTCKDMTDKECLYFCHQDIIW-OH
    三字母:H2N-Cys-Thr-Cys-Lys-Asp-Met-Thr-Asp-Lys-Glu-Cys-Leu-Tyr-Phe-Cys-His-Gln-Asp-Ile-Ile-Trp-OH(Disulfide Bridge:Cys1-Cys15 & Cys3-Cys11)
    氨基酸个数:21
    分子式:C112H167N27O34S5
    平均分子量:2596.01
    精确分子量:2594.08
    等电点(PI):9.07
    pH=7.0时的净电荷数:4.09
    酸性基团个数:-2.08
    碱性基团个数:亲水
    平均亲水性:-0.14761904761905
    疏水性值:-0.2
    外观与性状:白色粉末状固体
    闪点:6970 M-1cm-1
    消光系数:6990
    来源:人工化学合成,仅限科学研究使用,不得用于人体。
    纯度:95%、98%
    盐体系:可选TFA、HAc、HCl或其它
    储存条件:负80℃至负20℃
    标签:含Cys多肽   

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    沙漠角蝰毒肽 S6d 具有蛇毒来源结构限制,形成紧凑、受体活性构象。序列特征支持配体‑受体特异性建模。折叠模式显示效力与选择性决定因素。研究人员用其进行毒素比较与多肽结构研究。

    Sarafotoxin S6d exhibits venom-derived structural constraints yielding a compact, receptor-active conformation. Sequence characteristics support modeling of ligand-receptor specificity. Folding patterns reveal determinants of potency and selectivity. Researchers use it in toxin comparison and peptide-structure studies.

  • 多肽H2N-Cys-Thr-Cys-Lys-Asp-Met-Thr-Asp-Lys-Glu-Cys-Leu-Tyr-Phe-Cys-His-Gln-Asp-Ile-Ile-Trp-COOH的合成步骤:

    1、合成CTC树脂:称取2.44g CTC Resin(如初始取代度约为0.92mmol/g)和2.69mmol Fmoc-Trp(Boc)-OH于反应器中,加入适量DCM溶解氨基酸(需要注意,此时CTC树脂体积会增大好几倍,避免DCM溶液过少),再加入6.73mmol DIPEA(Mw:129.1,d:0.740g/ml),反应2-3小时后,可不抽滤溶液,直接加入1ml的HPLC级甲醇,封端半小时。依次用DMF洗涤2次,甲醇洗涤1次,DCM洗涤一次,甲醇洗涤一次,DCM洗涤一次,DMF洗涤2次(这里使用甲醇和DCM交替洗涤,是为了更好地去除其他溶质,有利于后续反应)。得到  Fmoc-Trp(Boc)-CTC Resin。结构图如下:

    2、脱Fmoc:加3倍树脂体积的20%Pip/DMF溶液,鼓氮气30分钟,然后2倍树脂体积的DMF 洗涤5次。得到 H2N-Trp(Boc)-CTC Resin 。(此步骤脱除Fmoc基团,茚三酮检测为蓝色,Pip为哌啶)。结构图如下:

    3、缩合:取6.73mmol Fmoc-Ile-OH 氨基酸,加入到上述树脂里,加适当DMF溶解氨基酸,再依次加入13.47mmol DIPEA,6.4mmol HBTU。反应30分钟后,取小样洗涤,茚三酮检测为无色。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂。(洗涤树脂,去掉残留溶剂,为下一步反应做准备)。得到Fmoc-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin。氨基酸:DIPEA:HBTU:树脂=3:6:2.85:1(摩尔比)。结构图如下:

    4、依次循环步骤二、步骤三,依次得到

    H2N-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    Fmoc-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    H2N-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    Fmoc-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    H2N-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    Fmoc-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    H2N-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    Fmoc-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    H2N-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    Fmoc-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    H2N-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    Fmoc-Phe-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    H2N-Phe-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    Fmoc-Tyr(tBu)-Phe-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    H2N-Tyr(tBu)-Phe-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    Fmoc-Leu-Tyr(tBu)-Phe-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    H2N-Leu-Tyr(tBu)-Phe-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    Fmoc-Cys(Trt)-Leu-Tyr(tBu)-Phe-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    H2N-Cys(Trt)-Leu-Tyr(tBu)-Phe-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    Fmoc-Glu(OtBu)-Cys(Trt)-Leu-Tyr(tBu)-Phe-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    H2N-Glu(OtBu)-Cys(Trt)-Leu-Tyr(tBu)-Phe-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    Fmoc-Lys(Boc)-Glu(OtBu)-Cys(Trt)-Leu-Tyr(tBu)-Phe-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    H2N-Lys(Boc)-Glu(OtBu)-Cys(Trt)-Leu-Tyr(tBu)-Phe-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    Fmoc-Asp(OtBu)-Lys(Boc)-Glu(OtBu)-Cys(Trt)-Leu-Tyr(tBu)-Phe-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    H2N-Asp(OtBu)-Lys(Boc)-Glu(OtBu)-Cys(Trt)-Leu-Tyr(tBu)-Phe-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    Fmoc-Thr(tBu)-Asp(OtBu)-Lys(Boc)-Glu(OtBu)-Cys(Trt)-Leu-Tyr(tBu)-Phe-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    H2N-Thr(tBu)-Asp(OtBu)-Lys(Boc)-Glu(OtBu)-Cys(Trt)-Leu-Tyr(tBu)-Phe-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    Fmoc-Met-Thr(tBu)-Asp(OtBu)-Lys(Boc)-Glu(OtBu)-Cys(Trt)-Leu-Tyr(tBu)-Phe-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    H2N-Met-Thr(tBu)-Asp(OtBu)-Lys(Boc)-Glu(OtBu)-Cys(Trt)-Leu-Tyr(tBu)-Phe-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    Fmoc-Asp(OtBu)-Met-Thr(tBu)-Asp(OtBu)-Lys(Boc)-Glu(OtBu)-Cys(Trt)-Leu-Tyr(tBu)-Phe-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    H2N-Asp(OtBu)-Met-Thr(tBu)-Asp(OtBu)-Lys(Boc)-Glu(OtBu)-Cys(Trt)-Leu-Tyr(tBu)-Phe-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    Fmoc-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Met-Thr(tBu)-Asp(OtBu)-Lys(Boc)-Glu(OtBu)-Cys(Trt)-Leu-Tyr(tBu)-Phe-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    H2N-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Met-Thr(tBu)-Asp(OtBu)-Lys(Boc)-Glu(OtBu)-Cys(Trt)-Leu-Tyr(tBu)-Phe-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    Fmoc-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Met-Thr(tBu)-Asp(OtBu)-Lys(Boc)-Glu(OtBu)-Cys(Trt)-Leu-Tyr(tBu)-Phe-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    H2N-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Met-Thr(tBu)-Asp(OtBu)-Lys(Boc)-Glu(OtBu)-Cys(Trt)-Leu-Tyr(tBu)-Phe-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    Fmoc-Thr(tBu)-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Met-Thr(tBu)-Asp(OtBu)-Lys(Boc)-Glu(OtBu)-Cys(Trt)-Leu-Tyr(tBu)-Phe-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    H2N-Thr(tBu)-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Met-Thr(tBu)-Asp(OtBu)-Lys(Boc)-Glu(OtBu)-Cys(Trt)-Leu-Tyr(tBu)-Phe-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    Fmoc-Cys(Trt)-Thr(tBu)-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Met-Thr(tBu)-Asp(OtBu)-Lys(Boc)-Glu(OtBu)-Cys(Trt)-Leu-Tyr(tBu)-Phe-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin

    以上中间结构,均可在专肽生物多肽计算器-多肽结构计算器中,一键画出。

    最后再经过步骤二得到 H2N-Cys(Trt)-Thr(tBu)-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Met-Thr(tBu)-Asp(OtBu)-Lys(Boc)-Glu(OtBu)-Cys(Trt)-Leu-Tyr(tBu)-Phe-Cys(Trt)-His(Trt)-Gln(Trt)-Asp(OtBu)-Ile-Ile-Trp(Boc)-CTC Resin,结构如下:

    5、切割:6倍树脂体积的切割液(或每1g树脂加8ml左右的切割液),摇床摇晃 2小时,过滤掉树脂,用冰无水乙醚沉淀滤液,并用冰无水乙醚洗涤沉淀物3次,最后将沉淀物放真空干燥釜中,常温干燥24小试,得到粗品H2N-Cys-Thr-Cys-Lys-Asp-Met-Thr-Asp-Lys-Glu-Cys-Leu-Tyr-Phe-Cys-His-Gln-Asp-Ile-Ile-Trp-COOH。结构图见产品结构图。

    切割液选择:1)TFA:H2O=95%:5%

    2)TFA:H2O:TIS=95%:2.5%:2.5%

    3)三氟乙酸:茴香硫醚:1,2-乙二硫醇:苯酚:水=87.5%:5%:2.5%:2.5%:2.5%

    (前两种适合没有容易氧化的氨基酸,例如Trp、Cys、Met。第三种适合几乎所有的序列。)

    6、纯化冻干:使用液相色谱纯化,收集目标峰液体,进行冻干,获得蓬松的粉末状固体多肽。不过这时要取小样复测下纯度 是否目标纯度。

    7、最后总结:

    杭州专肽生物技术有限公司(ALLPEPTIDE https://www.allpeptide.com)主营定制多肽合成业务,提供各类长肽,短肽,环肽,提供各类修饰肽,如:荧光标记修饰(CY3、CY5、CY5.5、CY7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等),功能基团修饰肽(叠氮、炔基、DBCO、DOTA、NOTA等),同位素标记肽(N15、C13),订书肽(Stapled Peptide),脂肪酸修饰肽(Pal、Myr、Ste),磷酸化修饰肽(P-Ser、P-Thr、P-Tyr),环肽(酰胺键环肽、一对或者多对二硫键环),生物素标记肽,PEG修饰肽,甲基化修饰肽等。

    以上所有内容,为专肽生物原创内容,请勿发布到其他网站上。

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