pro-memapsin-2 的荧光 (FRET) 底物包含 APP 瑞典突变的 β-分泌酶位点 EVNLDAEF。pH 4.5 时的动力学参数为 Km = 5.4 µM 和 kcat = 0.24 min⁻¹。
编号：164237
CAS号：310427-94-2
单字母：H2N-R-E(Edans)-EVNLDAEF-K(Dabcyl)-R-OH
Fluorogenic (FRET) substrate for pro-memapsin-2 containing the β-secretase site EVNLDAEF of the Swedish mutation of APP. The kinetic parameters at pH 4.5 are Km = 5.4 µM and kcat = 0.24 min⁻¹.
多肽荧光标记由于没有放射性，实验操作简单。因此，目前在生物学研究中多肽荧光标记应用非常广泛，多肽荧光标记方法与荧光试剂的结构有关系，对于有游离羧基的采用的方法与接多肽反应相同，也采用HBTU/HOBt/DIEA方法连接。 在N端标记FITC的多肽需经历环化作用来形成荧光素，通常会伴有最后一个氨基酸的去除，但当有一个间隔器如氨基己酸，或者是通过非酸性环境将目的多肽从树脂上切下来时，这种情况可避免在切割的过程中被TFA切割掉。
人们利用利用荧光标记的多肽来检测目标蛋白的活性，并将 其发展的高通量活性筛选方法应用于疾病治疗靶点蛋白的药物筛选和药物开发（例如，各种激 酶、磷酸酶、肽酶等）。
专肽生物能够提供技术成熟的各种荧光标记多肽。
下面是一些常见的多肽修饰荧光物质结构：
FITC标记
FITC(异硫氰酸荧光素)具有比较高的活性，我们公司可以通过两种方式将FITC标记于多肽 上：(1) 将FITC标记于赖氨酸（Lys）或被选择性地脱保护的鸟氨酸（ornithine）侧链氨基 上；(2) 将FITC标记于多肽N端氨基。
当在N端标记时，建议在最后一个氨基和由异硫氰酸酯与氨基反应产生的硫脲键之间引入 烷基间隔器（alkyl spacer），如氨基己酸（Ahx）。链接切割需要酸性环境，在N端标记FITC 的多肽需经历环化作用来形成荧光素，通常会伴有最后一个氨基酸的去除，但当有一个间隔器 如氨基己酸，或者是通过非酸性环境将目的肽从树脂上切下来时，这种情况可避免。空间位阻 被认为是在荧光染料前使用Ahx的主要原因，而不是为什么FITC不能直接偶联在多肽上的原因。
Ahx或b-Ala均可作为间隔器用于FITC标记的多肽上。
| 荧光修饰中文名称 | N端 | N端带有linker |
| 生物素标记多肽 | Biotin- | Biotin-Ahx- |
| 异硫氰酸荧光素 | FITC- | FITC-Ahx- |
| 5-羧基荧光素 | 5-FAM- | 5-FAM-Ahx- |
| 丹磺酰荧光素 | Dansyl- | Dansyl-Ahx- |
| 5-羧基四甲基罗丹明 | TMR- （TAMRA-） | TMR-Ahx- （TAMRA-Ahx-） |
| 多肽N端 | 多肽序列中间 | N端带有linker |
| 生物素标记多肽 | Biotin- | 多肽C端 |
| Lys(Biotin)- | -Lys(Biotin)-- | -Lys(Biotin) |
| Lys(FITC)- | -Lys(FITC)- | -Lys(FITC) |
| Lys(5-FAM)- | -Lys(5-FAM)- | -Lys(5-FAM) |
| Lys(Dansyl)- | -Lys(Dansyl)- | -Lys(Dansyl) |
| Lys(TMR)- | -Lys(TMR)- | -Lys(TMR) |
| Lys(Dnp)- | -Lys(Dnp)- | -Lys(Dnp) |
专肽常做的荧光物质的激发光波长和发射光波长。可供参考选择：
| 荧光基团 | Ex（nm） | Em（nm） | 荧光基团 | Ex（nm） | Em（nm） |
| 羟基香豆素 | 325 | 386 | R-phycoerythrin (PE) (489) | 565 | 578 |
| 丹磺酰氯 | 340 | 578 | Rhodamine Red-X | 560 | 580 |
| AMC | 345 | 445 | Tamara | 565 | 580 |
| 甲氧基香豆素 | 360 | 410 | Alexa fluor 555 | 556 | 573 |
| Alexa fluor 系列 | 345 | 442 | Alexa fluor 546 | 556 | 573 |
| 氨基香豆素 | 350 | 445 | Rox | 575 | 602 |
| Dabcyl | 453 | - | Alexa fluor 568 | 578 | 603 |
| Cy2 | 490 | 510 | Texas Red | 589 | 615 |
| FAM | 495 | 517 | Alexa fluor 594 | 590 | 617 |
| Alexa fluor 488 | 494 | 517 | Alexa fluor | 621 | 639 |
| FITC | 495 | 519 | Alexa fluor 633 | 650 | 668 |
| Alexa fluor 430 | 430 | 545 | Cy5 (625) | 650 | 670 |
| 5-FAM | 492 | 518 | Alexa fluor 660 | 663 | 690 |
| Alexa fluor 532 | 530 | 530 | Cy5.5 | 675 | 694 |
| HEX | 535 | 556 | TruRed | 490; 675 | 695 |
| 5-TAMRA | 542 | 568 | Alexa fluor 680 | 679 | 702 |
| Cy3 | 550 | 570 | Cy7 | 743 | 767 |
| TRITC | 547 | 572 | Cy3.5 | 581 | 596 |
| DOI | 名称 | |
|---|---|---|
| 10.1021/jm0611962 | Application of fragment screening by X-ray crystallography to beta-secretase | 下载 |
| 10.1021/jm061197u | Application of fragment screening by X-ray crystallography to the discovery of aminopyridines as inhibitors of beta-secretase | 下载 |
多肽H2N-Arg-Glu(Edans)-Glu-Val-Asn-Leu-Asp-Ala-Glu-Phe-Lys(Dabcyl)-Arg-COOH的合成步骤：
1、合成CTC树脂：称取2.64g CTC Resin（如初始取代度约为0.99mmol/g）和3.14mmol Fmoc-Arg(Pbf)-OH于反应器中，加入适量DCM溶解氨基酸（需要注意，此时CTC树脂体积会增大好几倍，避免DCM溶液过少），再加入7.84mmol DIPEA（Mw：129.1,d：0.740g/ml），反应2-3小时后，可不抽滤溶液，直接加入1ml的HPLC级甲醇，封端半小时。依次用DMF洗涤2次，甲醇洗涤1次，DCM洗涤一次，甲醇洗涤一次，DCM洗涤一次，DMF洗涤2次（这里使用甲醇和DCM交替洗涤，是为了更好地去除其他溶质，有利于后续反应）。得到 Fmoc-Arg(Pbf)-CTC Resin。结构图如下：
2、脱Fmoc：加3倍树脂体积的20%Pip/DMF溶液，鼓氮气30分钟，然后2倍树脂体积的DMF 洗涤5次。得到 H2N-Arg(Pbf)-CTC Resin 。（此步骤脱除Fmoc基团，茚三酮检测为蓝色，Pip为哌啶）。结构图如下：
3、缩合：取7.84mmol Fmoc-Lys(Dabcyl)-OH 氨基酸，加入到上述树脂里，加适当DMF溶解氨基酸，再依次加入15.68mmol DIPEA，7.45mmol HBTU。反应30分钟后，取小样洗涤，茚三酮检测为无色。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂。（洗涤树脂，去掉残留溶剂，为下一步反应做准备）。得到Fmoc-Lys(Dabcyl)-Arg(Pbf)-CTC Resin。氨基酸：DIPEA：HBTU：树脂=3：6：2.85：1（摩尔比）。结构图如下：
4、依次循环步骤二、步骤三，依次得到
H2N-Lys(Dabcyl)-Arg(Pbf)-CTC Resin
Fmoc-Phe-Lys(Dabcyl)-Arg(Pbf)-CTC Resin
H2N-Phe-Lys(Dabcyl)-Arg(Pbf)-CTC Resin
Fmoc-Glu(OtBu)-Phe-Lys(Dabcyl)-Arg(Pbf)-CTC Resin
H2N-Glu(OtBu)-Phe-Lys(Dabcyl)-Arg(Pbf)-CTC Resin
Fmoc-Ala-Glu(OtBu)-Phe-Lys(Dabcyl)-Arg(Pbf)-CTC Resin
H2N-Ala-Glu(OtBu)-Phe-Lys(Dabcyl)-Arg(Pbf)-CTC Resin
Fmoc-Asp(OtBu)-Ala-Glu(OtBu)-Phe-Lys(Dabcyl)-Arg(Pbf)-CTC Resin
H2N-Asp(OtBu)-Ala-Glu(OtBu)-Phe-Lys(Dabcyl)-Arg(Pbf)-CTC Resin
Fmoc-Leu-Asp(OtBu)-Ala-Glu(OtBu)-Phe-Lys(Dabcyl)-Arg(Pbf)-CTC Resin
H2N-Leu-Asp(OtBu)-Ala-Glu(OtBu)-Phe-Lys(Dabcyl)-Arg(Pbf)-CTC Resin
Fmoc-Asn(Trt)-Leu-Asp(OtBu)-Ala-Glu(OtBu)-Phe-Lys(Dabcyl)-Arg(Pbf)-CTC Resin
H2N-Asn(Trt)-Leu-Asp(OtBu)-Ala-Glu(OtBu)-Phe-Lys(Dabcyl)-Arg(Pbf)-CTC Resin
Fmoc-Val-Asn(Trt)-Leu-Asp(OtBu)-Ala-Glu(OtBu)-Phe-Lys(Dabcyl)-Arg(Pbf)-CTC Resin
H2N-Val-Asn(Trt)-Leu-Asp(OtBu)-Ala-Glu(OtBu)-Phe-Lys(Dabcyl)-Arg(Pbf)-CTC Resin
Fmoc-Glu(OtBu)-Val-Asn(Trt)-Leu-Asp(OtBu)-Ala-Glu(OtBu)-Phe-Lys(Dabcyl)-Arg(Pbf)-CTC Resin
H2N-Glu(OtBu)-Val-Asn(Trt)-Leu-Asp(OtBu)-Ala-Glu(OtBu)-Phe-Lys(Dabcyl)-Arg(Pbf)-CTC Resin
Fmoc-Glu(Edans)-Glu(OtBu)-Val-Asn(Trt)-Leu-Asp(OtBu)-Ala-Glu(OtBu)-Phe-Lys(Dabcyl)-Arg(Pbf)-CTC Resin
H2N-Glu(Edans)-Glu(OtBu)-Val-Asn(Trt)-Leu-Asp(OtBu)-Ala-Glu(OtBu)-Phe-Lys(Dabcyl)-Arg(Pbf)-CTC Resin
Fmoc-Arg(Pbf)-Glu(Edans)-Glu(OtBu)-Val-Asn(Trt)-Leu-Asp(OtBu)-Ala-Glu(OtBu)-Phe-Lys(Dabcyl)-Arg(Pbf)-CTC Resin
以上中间结构，均可在专肽生物多肽计算器-多肽结构计算器中，一键画出。
最后再经过步骤二得到 H2N-Arg(Pbf)-Glu(Edans)-Glu(OtBu)-Val-Asn(Trt)-Leu-Asp(OtBu)-Ala-Glu(OtBu)-Phe-Lys(Dabcyl)-Arg(Pbf)-CTC Resin，结构如下：
5、切割：6倍树脂体积的切割液（或每1g树脂加8ml左右的切割液），摇床摇晃 2小时，过滤掉树脂，用冰无水乙醚沉淀滤液，并用冰无水乙醚洗涤沉淀物3次，最后将沉淀物放真空干燥釜中，常温干燥24小试，得到粗品H2N-Arg-Glu(Edans)-Glu-Val-Asn-Leu-Asp-Ala-Glu-Phe-Lys(Dabcyl)-Arg-COOH。结构图见产品结构图。
切割液选择：1）TFA：H2O=95%：5%
2）TFA：H2O：TIS=95%：2.5%：2.5%
3）三氟乙酸：茴香硫醚：1，2-乙二硫醇：苯酚：水=87.5%：5%：2.5%：2.5%：2.5%
（前两种适合没有容易氧化的氨基酸，例如Trp、Cys、Met。第三种适合几乎所有的序列。）
6、纯化冻干：使用液相色谱纯化，收集目标峰液体，进行冻干，获得蓬松的粉末状固体多肽。不过这时要取小样复测下纯度 是否目标纯度。
7、最后总结：
杭州专肽生物技术有限公司（ALLPEPTIDE https://www.allpeptide.com）主营定制多肽合成业务，提供各类长肽，短肽，环肽，提供各类修饰肽，如：荧光标记修饰（CY3、CY5、CY5.5、CY7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等），功能基团修饰肽（叠氮、炔基、DBCO、DOTA、NOTA等），同位素标记肽（N15、C13），订书肽（Stapled Peptide）,脂肪酸修饰肽（Pal、Myr、Ste），磷酸化修饰肽（P-Ser、P-Thr、P-Tyr），环肽（酰胺键环肽、一对或者多对二硫键环），生物素标记肽，PEG修饰肽，甲基化修饰肽等。
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