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N端Fmoc保护，9-芴甲氧羰基（Fmoc）是伯胺和仲胺的保护基团。在固相肽合成（SPPS）中，它是氨基酸主链的常用保护基，因为它可以很容易地用哌啶去除，而不会干扰树脂和肽之间的酸不稳定连接体。

侧链Trt保护的组氨酸

α-氨基异丁酸（α-甲基丙氨酸）是一种非蛋白氨基酸，能促进肽段形成螺旋构象。

C端甲酯化修饰，甲酯是最简单的酯类，在溶液合成中作为重要的半永久性C端保护基团。它们可以转化为肽肼，而肽肼是反应性肽叠氮化物的先驱体。叠氮偶联仍是肽溶液合成中片段偶联最常用的方法。