多肽SPASARAV的参数和合成路线|三字母为Ser-Pro-Ala-Ser-Ala-Arg-Ala-Val|专肽生物产品-定制多肽合成服务
文章目录
一、多肽Ser-Pro-Ala-Ser-Ala-Arg-Ala-Val|SPASARAV的结构图
二、多肽Ser-Pro-Ala-Ser-Ala-Arg-Ala-Val|SPASARAV的多肽参数
三、多肽Ser-Pro-Ala-Ser-Ala-Arg-Ala-Val|SPASARAV的静电荷图
四、多肽Ser-Pro-Ala-Ser-Ala-Arg-Ala-Val|SPASARAV的亲疏水比例统计（条形图）
五、多肽Ser-Pro-Ala-Ser-Ala-Arg-Ala-Val|SPASARAV的亲疏水性氨基酸、极性非极性氨基酸、酸碱性氨基酸的统计（扇形图）
六、多肽Ser-Pro-Ala-Ser-Ala-Arg-Ala-Val|SPASARAV的合成步骤
专肽生物官网：https://www.allpeptide.com （以下图片均由专肽生物多肽结构计算器自动生成）
一、Ser-Pro-Ala-Ser-Ala-Arg-Ala-Val的结构图如下
二、Ser-Pro-Ala-Ser-Ala-Arg-Ala-Val的多肽参数如下
单字母：H2N-SPASARAV-OH
三字母：H2N-Ser-Pro-Ala-Ser-Ala-Arg-Ala-Val-COOH
中文序列：丝氨酸-脯氨酸-丙氨酸-丝氨酸-丙氨酸-精氨酸-丙氨酸-缬氨酸
氨基酸个数：8
分子式：C31H55N11O11
平均分子量：757.84
精确分子量(Exact Mass)：757.41
等电点(PI)：10.56
pH=7.0时的净电荷数：0.98
GRAVY值：0.24
亲水残基比例：-
消光系数：-
平均亲水性及多肽溶解建议：亲水（该多肽在纯水中溶解性较好，大多数情况下无需助溶）
三、H2N-SPASARAV-OH的静电荷图
四、多肽Ser-Pro-Ala-Ser-Ala-Arg-Ala-Val的亲疏水比例统计（条形图）
五、多肽Ser-Pro-Ala-Ser-Ala-Arg-Ala-Val的亲疏水性氨基酸、极性非极性氨基酸、酸碱性氨基酸的统计（扇形图）
六、多肽Ser-Pro-Ala-Ser-Ala-Arg-Ala-Val的合成步骤：
1、合成CTC树脂：称取0.3g CTC Resin（如初始取代度约为1.0mmol/g）和0.4 mmol的Fmoc-Val-OH于反应器中，加入适量DCM溶解氨基酸（需要注意，此时CTC树脂体积会增大好几倍，避免DCM溶液过少），再加入树脂0.9 mmol的DIPEA((Mw：129.1,d：0.740g/ml))，反应2-3小时后，可不抽滤溶液，直接加入1ml的HPLC级甲醇，封端半小时。依次用DMF洗涤2次，甲醇洗涤1次，DCM洗涤一次，甲醇洗涤一次，DCM洗涤一次，DMF洗涤2次(这里使用甲醇和DCM交替洗涤，是为了更好地去除其他溶质，有利于后续反应)。得到Fmoc-Val-CTC Resin备用。结构图如下：
2、脱Fmoc：加3倍树脂体积的20%Pip/DMF溶液，鼓氮气30分钟，然后2倍树脂体积的DMF 洗涤5次。得到H2N-Val-CTC Resin。（此步骤脱除Fmoc基团，茚三酮检测为蓝色）。结构图如下：
3、缩合：取2.7mmol Fmoc-Ala-OH 氨基酸,加入到上述树脂里，加适当DMF溶解氨基酸，再分别加入1.8mmol DIPEA,1.67mmol HBTU。反应30分钟后，用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂。（洗涤树脂，去掉残留溶剂，为下一步反应做准备）。得到Fmoc-Ala-Val-CTC Resin。氨基酸：DIPEA：HBTU：树脂=3：6：2.85：1（摩尔比）。结构图如下：
4、依次循环步骤二、步骤三，依次得到
H2N-Ala-Val-CTC Resin
Fmoc-Arg(Pbf)-Ala-Val-CTC Resin
H2N-Arg(Pbf)-Ala-Val-CTC Resin
Fmoc-Ala-Arg(Pbf)-Ala-Val-CTC Resin
H2N-Ala-Arg(Pbf)-Ala-Val-CTC Resin
Fmoc-Ser(tBu)-Ala-Arg(Pbf)-Ala-Val-CTC Resin
H2N-Ser(tBu)-Ala-Arg(Pbf)-Ala-Val-CTC Resin
Fmoc-Ala-Ser(tBu)-Ala-Arg(Pbf)-Ala-Val-CTC Resin
H2N-Ala-Ser(tBu)-Ala-Arg(Pbf)-Ala-Val-CTC Resin
Fmoc-Pro-Ala-Ser(tBu)-Ala-Arg(Pbf)-Ala-Val-CTC Resin
H2N-Pro-Ala-Ser(tBu)-Ala-Arg(Pbf)-Ala-Val-CTC Resin
Fmoc-Ser(tBu)-Pro-Ala-Ser(tBu)-Ala-Arg(Pbf)-Ala-Val-CTC Resin
最后再经过步骤二得到 H2N-Ser(tBu)-Pro-Ala-Ser(tBu)-Ala-Arg(Pbf)-Ala-Val-CTC Resin，结构图如下：
5、切割：6倍树脂体积的切割液（或每1g树脂加8ml左右的切割液），摇床摇晃 2小时，过滤掉树脂，用冰无水乙醚沉淀滤液，并用冰无水乙醚洗涤沉淀物3次，最后将沉淀物放真空干燥釜中，常温干燥24小试，得到粗品 Ser-Pro-Ala-Ser-Ala-Arg-Ala-Val。
切割液选择：1）TFA：H2O=95%：5%、TFA：H2O=97.5%：2.5%
2）TFA：H2O：TIS=95%：2.5%：2.5%
3）三氟乙酸：茴香硫醚：1，2-乙二硫醇：苯酚：水=87.5%：5%：2.5%：2.5%：2.5%
（前两种适合没有容易氧化的氨基酸，例如Trp、Cys、Met。第三种适合几乎所有的序列。）
6、纯化冻干：使用液相色谱纯化，收集目标峰液体，进行冻干，获得蓬松的粉末状固体多肽。不过这时要取小样复测下纯度 是否目标纯度。
七、最后总结：
杭州专肽生物技术公司定制多肽合成业务:荧光标记肽（Cy3、Cy5、Cy5.5、Cy7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等），同位素标记（N15、C13），订书肽（Stapled Peptide），脂肪酸修饰肽（Pal、Myr、Ste），磷酸化修饰肽（p-Ser、p-Thr、p-Tyr），环肽（酰胺环、一对或多对二硫键环及定点成环），生物素标记肽（BIOTIN），复合抗原肽（MAP4、MAP8、MAP16），螯合剂（HYNIC），小分子化合物，PEG修饰，荧光淬灭基团标记（EDANS、DABCYL），甲基化修饰（Lys、Arg），光敏剂修饰，DOTA，NOTA，DOPA，叠氮修饰，两支不同序列的分支肽，两条不同序列多肽之间的多对二硫键等。
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