多肽INIYAWWS的参数和合成路线|三字母为Ile-Asn-Ile-Tyr-Ala-Trp-Trp-Ser|专肽生物产品-定制多肽合成服务
文章目录
一、多肽Ile-Asn-Ile-Tyr-Ala-Trp-Trp-Ser|INIYAWWS的结构图
二、多肽Ile-Asn-Ile-Tyr-Ala-Trp-Trp-Ser|INIYAWWS的多肽参数
三、多肽Ile-Asn-Ile-Tyr-Ala-Trp-Trp-Ser|INIYAWWS的静电荷图
四、多肽Ile-Asn-Ile-Tyr-Ala-Trp-Trp-Ser|INIYAWWS的亲疏水比例统计(条形图)
五、多肽Ile-Asn-Ile-Tyr-Ala-Trp-Trp-Ser|INIYAWWS的亲疏水性氨基酸、极性非极性氨基酸、酸碱性氨基酸的统计(扇形图)
六、多肽Ile-Asn-Ile-Tyr-Ala-Trp-Trp-Ser|INIYAWWS的合成步骤
专肽生物官网:https://www.allpeptide.com (以下图片均由专肽生物多肽结构计算器自动生成)
一、Ile-Asn-Ile-Tyr-Ala-Trp-Trp-Ser的结构图如下
二、Ile-Asn-Ile-Tyr-Ala-Trp-Trp-Ser的多肽参数如下
单字母:H2N-INIYAWWS-OH
三字母:H2N-Ile-Asn-Ile-Tyr-Ala-Trp-Trp-Ser-COOH
中文序列:异亮氨酸-天冬酰胺-异亮氨酸-酪氨酸-丙氨酸-色氨酸-色氨酸-丝氨酸
氨基酸个数:8
分子式:C53H69N11O12
平均分子量:1052.18
精确分子量(Exact Mass):1051.51
等电点(PI):9.36
pH=7.0时的净电荷数:0.97
GRAVY值:0.48
亲水残基比例:-
消光系数:12490
平均亲水性及多肽溶解建议:疏水(该多肽在水中的溶解性一般,可选择以下方式助溶: 1、调整溶液的PH助溶(含Cys等氨基酸尽量不调为碱性) 2、超声助溶(含Cys、Ser等氨基酸需减少超声时间) 3、加热助溶(溶液温度≤30℃) 4、添加助溶剂(如DMSO,DMF等,建议遵循先有机溶液后无机溶液的原则)。 5、对于碱性肽,建议用10%乙酸溶解,对于酸性肽,建议用5-10%氨水溶解。
三、H2N-INIYAWWS-OH的静电荷图
四、多肽Ile-Asn-Ile-Tyr-Ala-Trp-Trp-Ser的亲疏水比例统计(条形图)
五、多肽Ile-Asn-Ile-Tyr-Ala-Trp-Trp-Ser的亲疏水性氨基酸、极性非极性氨基酸、酸碱性氨基酸的统计(扇形图)
六、多肽Ile-Asn-Ile-Tyr-Ala-Trp-Trp-Ser的合成步骤:
1、合成CTC树脂:称取0.3g CTC Resin(如初始取代度约为1.0mmol/g)和0.4 mmol的Fmoc-Ser(tBu)-OH于反应器中,加入适量DCM溶解氨基酸(需要注意,此时CTC树脂体积会增大好几倍,避免DCM溶液过少),再加入树脂0.9 mmol的DIPEA((Mw:129.1,d:0.740g/ml)),反应2-3小时后,可不抽滤溶液,直接加入1ml的HPLC级甲醇,封端半小时。依次用DMF洗涤2次,甲醇洗涤1次,DCM洗涤一次,甲醇洗涤一次,DCM洗涤一次,DMF洗涤2次(这里使用甲醇和DCM交替洗涤,是为了更好地去除其他溶质,有利于后续反应)。得到Fmoc-Ser(tBu)-CTC Resin备用。结构图如下:
2、脱Fmoc:加3倍树脂体积的20%Pip/DMF溶液,鼓氮气30分钟,然后2倍树脂体积的DMF 洗涤5次。得到H2N-Ser(tBu)-CTC Resin。(此步骤脱除Fmoc基团,茚三酮检测为蓝色)。结构图如下:
3、缩合:取2.7mmol Fmoc-Trp(Boc)-OH 氨基酸,加入到上述树脂里,加适当DMF溶解氨基酸,再分别加入1.8mmol DIPEA,1.67mmol HBTU。反应30分钟后,用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂。(洗涤树脂,去掉残留溶剂,为下一步反应做准备)。得到Fmoc-Trp(Boc)-Ser(tBu)-CTC Resin。氨基酸:DIPEA:HBTU:树脂=3:6:2.85:1(摩尔比)。结构图如下:
4、依次循环步骤二、步骤三,依次得到
H2N-Trp(Boc)-Ser(tBu)-CTC Resin
Fmoc-Trp(Boc)-Trp(Boc)-Ser(tBu)-CTC Resin
H2N-Trp(Boc)-Trp(Boc)-Ser(tBu)-CTC Resin
Fmoc-Ala-Trp(Boc)-Trp(Boc)-Ser(tBu)-CTC Resin
H2N-Ala-Trp(Boc)-Trp(Boc)-Ser(tBu)-CTC Resin
Fmoc-Tyr(tBu)-Ala-Trp(Boc)-Trp(Boc)-Ser(tBu)-CTC Resin
H2N-Tyr(tBu)-Ala-Trp(Boc)-Trp(Boc)-Ser(tBu)-CTC Resin
Fmoc-Ile-Tyr(tBu)-Ala-Trp(Boc)-Trp(Boc)-Ser(tBu)-CTC Resin
H2N-Ile-Tyr(tBu)-Ala-Trp(Boc)-Trp(Boc)-Ser(tBu)-CTC Resin
Fmoc-Asn(Trt)-Ile-Tyr(tBu)-Ala-Trp(Boc)-Trp(Boc)-Ser(tBu)-CTC Resin
H2N-Asn(Trt)-Ile-Tyr(tBu)-Ala-Trp(Boc)-Trp(Boc)-Ser(tBu)-CTC Resin
Fmoc-Ile-Asn(Trt)-Ile-Tyr(tBu)-Ala-Trp(Boc)-Trp(Boc)-Ser(tBu)-CTC Resin
最后再经过步骤二得到 H2N-Ile-Asn(Trt)-Ile-Tyr(tBu)-Ala-Trp(Boc)-Trp(Boc)-Ser(tBu)-CTC Resin,结构图如下:
5、切割:6倍树脂体积的切割液(或每1g树脂加8ml左右的切割液),摇床摇晃 2小时,过滤掉树脂,用冰无水乙醚沉淀滤液,并用冰无水乙醚洗涤沉淀物3次,最后将沉淀物放真空干燥釜中,常温干燥24小试,得到粗品 Ile-Asn-Ile-Tyr-Ala-Trp-Trp-Ser。
切割液选择:1)TFA:H2O=95%:5%、TFA:H2O=97.5%:2.5%
2)TFA:H2O:TIS=95%:2.5%:2.5%
3)三氟乙酸:茴香硫醚:1,2-乙二硫醇:苯酚:水=87.5%:5%:2.5%:2.5%:2.5%
(前两种适合没有容易氧化的氨基酸,例如Trp、Cys、Met。第三种适合几乎所有的序列。)
6、纯化冻干:使用液相色谱纯化,收集目标峰液体,进行冻干,获得蓬松的粉末状固体多肽。不过这时要取小样复测下纯度 是否目标纯度。
七、最后总结:
杭州专肽生物技术公司定制多肽合成业务:荧光标记肽(Cy3、Cy5、Cy5.5、Cy7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等),同位素标记(N15、C13),订书肽(Stapled Peptide),脂肪酸修饰肽(Pal、Myr、Ste),磷酸化修饰肽(p-Ser、p-Thr、p-Tyr),环肽(酰胺环、一对或多对二硫键环及定点成环),生物素标记肽(BIOTIN),复合抗原肽(MAP4、MAP8、MAP16),螯合剂(HYNIC),小分子化合物,PEG修饰,荧光淬灭基团标记(EDANS、DABCYL),甲基化修饰(Lys、Arg),光敏剂修饰,DOTA,NOTA,DOPA,叠氮修饰,两支不同序列的分支肽,两条不同序列多肽之间的多对二硫键等。
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