大多数膜通透性测定是在基于细胞的系统(如 CACO-2)或非膜无细胞系统(如 PAMPA)中进行的。我们正在开发一种基于脂质体的渗透性系统,旨在反映生理上准确的磷脂双层中的被动渗透性。
我们正在开发构建环状肽的新方法,其灵感来自于天然产物,例如环孢菌素 A、destruxins 和 aureobasidin E。这些环状肽中的许多都包含主链修饰,例如 N-甲基化和内酯 (depsi) 键,用于增加它们的结构多样性并增强膜通透性和代谢稳定性。我们对新的合成方法感兴趣,这些方法有助于合成含有这些非蛋白氨基酸和连接的环状肽的天然产物样文库。
我们正在使用面向多样性的合成技术来生成受天然产物启发的大型环状肽库。我们正在使用从模型系统研究中学到的原则,使图书馆成员偏向于膜通透性和代谢稳定性。
许多天然产物的结构复杂性使它们有别于普通的合成药物,使它们能够进入超出常规小分子药物靶向的酶活性位点和受体的生物靶标空间。尤其是天然存在的环肽,表现出一系列生物活性,其多样性反映在其丰富的结构多样性中。这些化合物中的许多化合物通过被动扩散渗透细胞,而一些化合物,如环孢菌素 A,是临床使用的口服生物可利用药物。这些天然产物的分子量和极性基团数量往往超出基于“药物相似性”的经典预测指标的标准。由于它们的大小和复杂性,与较小的无环化合物相比,环肽可以对生物靶标表现出更高的特异性和效力,它们可能为调节更具挑战性的生物靶标提供有用的支架,例如蛋白质-蛋白质相互作用和变构结合位点。我们的研究从结构的角度关注环肽天然产物,希望发现可能解释其意外药代动力学行为的趋势。