这里通过专肽生物多肽结构计算器 展示下 ,如何使用4个氨基酸形成一个含有6个氨基的肽段。
目前侧链含有氨基的氨基酸有 赖氨酸Lys、鸟氨酸Orn 和Dab Dap等,我们以赖氨酸Lys为例,4个Lys形成的肽段Lys-Lys-Lys-Lys,结构如下图。
从结构中可以看出,只有5个氨基,并没有6个氨基,这是我们注意到C端有个羧基,可否将羧基转换成氨基?
我们常用的方法是,在C端接一个 乙二胺,例如在多肽结构图计算器中输入 Lys-Lys-Lys-Lys-Lys-EDA 或 Lys-Lys-Lys-Lys-Lys-乙二胺,得到下图
这是我们注意到,此肽段中,一共含有6个氨基,且没有其它活性基团。
氨基酸Lys的个数,可以适当增加一些,例如10个Lys形成12个氨基,序列写法为 Lys-Lys-Lys-Lys-Lys-Lys-Lys-Lys-Lys-Lys-EDA,或KKKKKKKKKK-EDA,结构展示如下图