多肽的两端假如不封端的话，就会携带游离的氨基（N端）和游离的羧基（C端），而多肽的序列往往代表了母本蛋白的序列，为了与母本蛋白更为接近，多肽的两端往往需要封闭，即N端乙酰化和C端酰胺化，这些修饰会减少多肽的总电荷，降低多肽的溶解度，也可以使多肽模拟它在母本蛋白中α氨基和羧基的原始状态。
下面，我们用多肽结构计算器 来展示下多肽N端乙酰化和多肽C端酰胺化。
例如我们随便给个序列RGDRGD，这种写法，代表左边N端是氨基形式，右边C端是羧基形式
输入到多肽结构计算器中，得到下图
左边的氨基H2N 具有正电荷，右边的羧基COOH 具有负电荷。其水溶解性相对封端之后的 要好很多。
那么假如RGDRGD 进行N端乙酰化和C端酰胺化之后，会是怎样子的？
序列写法有很多种，例如Ac-RGDRGD-NH2；
Ac可以替换为Acetyl、乙酰化、Acetylated、Acetylation等
NH2可以替换为 CONH2、酰胺化、amide等
输入到多肽结构图计算器中，得到下图
此时多肽的两端没有电荷了，更像它在母本蛋白中α氨基和羧基的原始状态，不过多肽的水溶解度降低了。
温馨提示：您在文献中查阅多肽序列时，需要注意下多肽的两端是否有封端的说明。
