多肽WNYTHVDWWPAACKD的参数和合成路线|三字母为Trp-Asn-Tyr-Thr-His-Val-Asp-Trp-Trp-Pro-Ala-Ala-Cys-Lys-Asp|专肽生物产品-定制多肽合成服务
文章目录
一、多肽Trp-Asn-Tyr-Thr-His-Val-Asp-Trp-Trp-Pro-Ala-Ala-Cys-Lys-Asp|WNYTHVDWWPAACKD的结构图
二、多肽Trp-Asn-Tyr-Thr-His-Val-Asp-Trp-Trp-Pro-Ala-Ala-Cys-Lys-Asp|WNYTHVDWWPAACKD的多肽参数
三、多肽Trp-Asn-Tyr-Thr-His-Val-Asp-Trp-Trp-Pro-Ala-Ala-Cys-Lys-Asp|WNYTHVDWWPAACKD的静电荷图
四、多肽Trp-Asn-Tyr-Thr-His-Val-Asp-Trp-Trp-Pro-Ala-Ala-Cys-Lys-Asp|WNYTHVDWWPAACKD的亲疏水比例统计（条形图）
五、多肽Trp-Asn-Tyr-Thr-His-Val-Asp-Trp-Trp-Pro-Ala-Ala-Cys-Lys-Asp|WNYTHVDWWPAACKD的亲疏水性氨基酸、极性非极性氨基酸、酸碱性氨基酸的统计（扇形图）
六、多肽Trp-Asn-Tyr-Thr-His-Val-Asp-Trp-Trp-Pro-Ala-Ala-Cys-Lys-Asp|WNYTHVDWWPAACKD的合成步骤
专肽生物官网：https://www.allpeptide.com （以下图片均由专肽生物多肽结构计算器自动生成）
一、Trp-Asn-Tyr-Thr-His-Val-Asp-Trp-Trp-Pro-Ala-Ala-Cys-Lys-Asp的结构图如下
二、Trp-Asn-Tyr-Thr-His-Val-Asp-Trp-Trp-Pro-Ala-Ala-Cys-Lys-Asp的多肽参数如下
单字母：H2N-WNYTHVDWWPAACKD-OH
三字母：H2N-Trp-Asn-Tyr-Thr-His-Val-Asp-Trp-Trp-Pro-Ala-Ala-Cys-Lys-Asp-COOH
中文序列：色氨酸-天冬酰胺-酪氨酸-苏氨酸-组氨酸-缬氨酸-天冬氨酸-色氨酸-色氨酸-脯氨酸-丙氨酸-丙氨酸-半胱氨酸-赖氨酸-天冬氨酸
氨基酸个数：15
分子式：C89H114N22O23S1
平均分子量：1892.06
精确分子量(Exact Mass)：1890.81
等电点(PI)：8.54
pH=7.0时的净电荷数：1.18
GRAVY值：-0.88
亲水残基比例：0.12
消光系数：17990
平均亲水性及多肽溶解建议：疏水（该多肽在水中的溶解性一般，可选择以下方式助溶： 1、调整溶液的PH助溶（含Cys等氨基酸尽量不调为碱性） 2、超声助溶（含Cys、Ser等氨基酸需减少超声时间） 3、加热助溶（溶液温度≤30℃） 4、添加助溶剂（如DMSO，DMF等，建议遵循先有机溶液后无机溶液的原则）。 5、对于碱性肽，建议用10%乙酸溶解，对于酸性肽，建议用5-10%氨水溶解。
三、H2N-WNYTHVDWWPAACKD-OH的静电荷图
四、多肽Trp-Asn-Tyr-Thr-His-Val-Asp-Trp-Trp-Pro-Ala-Ala-Cys-Lys-Asp的亲疏水比例统计（条形图）
五、多肽Trp-Asn-Tyr-Thr-His-Val-Asp-Trp-Trp-Pro-Ala-Ala-Cys-Lys-Asp的亲疏水性氨基酸、极性非极性氨基酸、酸碱性氨基酸的统计（扇形图）
六、多肽Trp-Asn-Tyr-Thr-His-Val-Asp-Trp-Trp-Pro-Ala-Ala-Cys-Lys-Asp的合成步骤：
1、合成CTC树脂：称取0.3g CTC Resin（如初始取代度约为1.0mmol/g）和0.4 mmol的Fmoc-Asp(OtBu)-OH于反应器中，加入适量DCM溶解氨基酸（需要注意，此时CTC树脂体积会增大好几倍，避免DCM溶液过少），再加入树脂0.9 mmol的DIPEA((Mw：129.1,d：0.740g/ml))，反应2-3小时后，可不抽滤溶液，直接加入1ml的HPLC级甲醇，封端半小时。依次用DMF洗涤2次，甲醇洗涤1次，DCM洗涤一次，甲醇洗涤一次，DCM洗涤一次，DMF洗涤2次(这里使用甲醇和DCM交替洗涤，是为了更好地去除其他溶质，有利于后续反应)。得到Fmoc-Asp(OtBu)-CTC Resin备用。结构图如下：
2、脱Fmoc：加3倍树脂体积的20%Pip/DMF溶液，鼓氮气30分钟，然后2倍树脂体积的DMF 洗涤5次。得到H2N-Asp(OtBu)-CTC Resin。（此步骤脱除Fmoc基团，茚三酮检测为蓝色）。结构图如下：
3、缩合：取2.7mmol Fmoc-Lys(Boc)-OH 氨基酸,加入到上述树脂里，加适当DMF溶解氨基酸，再分别加入1.8mmol DIPEA,1.67mmol HBTU。反应30分钟后，用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂。（洗涤树脂，去掉残留溶剂，为下一步反应做准备）。得到Fmoc-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-CTC Resin。氨基酸：DIPEA：HBTU：树脂=3：6：2.85：1（摩尔比）。结构图如下：
4、依次循环步骤二、步骤三，依次得到
H2N-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-CTC Resin
Fmoc-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-CTC Resin
H2N-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-CTC Resin
Fmoc-Ala-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-CTC Resin
H2N-Ala-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-CTC Resin
Fmoc-Ala-Ala-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-CTC Resin
H2N-Ala-Ala-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-CTC Resin
Fmoc-Pro-Ala-Ala-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-CTC Resin
H2N-Pro-Ala-Ala-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-CTC Resin
Fmoc-Trp(Boc)-Pro-Ala-Ala-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-CTC Resin
H2N-Trp(Boc)-Pro-Ala-Ala-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-CTC Resin
Fmoc-Trp(Boc)-Trp(Boc)-Pro-Ala-Ala-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-CTC Resin
H2N-Trp(Boc)-Trp(Boc)-Pro-Ala-Ala-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-CTC Resin
Fmoc-Asp(OtBu)-Trp(Boc)-Trp(Boc)-Pro-Ala-Ala-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-CTC Resin
H2N-Asp(OtBu)-Trp(Boc)-Trp(Boc)-Pro-Ala-Ala-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-CTC Resin
Fmoc-Val-Asp(OtBu)-Trp(Boc)-Trp(Boc)-Pro-Ala-Ala-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-CTC Resin
H2N-Val-Asp(OtBu)-Trp(Boc)-Trp(Boc)-Pro-Ala-Ala-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-CTC Resin
Fmoc-His(Trt)-Val-Asp(OtBu)-Trp(Boc)-Trp(Boc)-Pro-Ala-Ala-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-CTC Resin
H2N-His(Trt)-Val-Asp(OtBu)-Trp(Boc)-Trp(Boc)-Pro-Ala-Ala-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-CTC Resin
Fmoc-Thr(tBu)-His(Trt)-Val-Asp(OtBu)-Trp(Boc)-Trp(Boc)-Pro-Ala-Ala-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-CTC Resin
H2N-Thr(tBu)-His(Trt)-Val-Asp(OtBu)-Trp(Boc)-Trp(Boc)-Pro-Ala-Ala-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-CTC Resin
Fmoc-Tyr(tBu)-Thr(tBu)-His(Trt)-Val-Asp(OtBu)-Trp(Boc)-Trp(Boc)-Pro-Ala-Ala-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-CTC Resin
H2N-Tyr(tBu)-Thr(tBu)-His(Trt)-Val-Asp(OtBu)-Trp(Boc)-Trp(Boc)-Pro-Ala-Ala-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-CTC Resin
Fmoc-Asn(Trt)-Tyr(tBu)-Thr(tBu)-His(Trt)-Val-Asp(OtBu)-Trp(Boc)-Trp(Boc)-Pro-Ala-Ala-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-CTC Resin
H2N-Asn(Trt)-Tyr(tBu)-Thr(tBu)-His(Trt)-Val-Asp(OtBu)-Trp(Boc)-Trp(Boc)-Pro-Ala-Ala-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-CTC Resin
Fmoc-Trp(Boc)-Asn(Trt)-Tyr(tBu)-Thr(tBu)-His(Trt)-Val-Asp(OtBu)-Trp(Boc)-Trp(Boc)-Pro-Ala-Ala-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-CTC Resin
最后再经过步骤二得到 H2N-Trp(Boc)-Asn(Trt)-Tyr(tBu)-Thr(tBu)-His(Trt)-Val-Asp(OtBu)-Trp(Boc)-Trp(Boc)-Pro-Ala-Ala-Cys(Trt)-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-CTC Resin，结构图如下：
5、切割：6倍树脂体积的切割液（或每1g树脂加8ml左右的切割液），摇床摇晃 2小时，过滤掉树脂，用冰无水乙醚沉淀滤液，并用冰无水乙醚洗涤沉淀物3次，最后将沉淀物放真空干燥釜中，常温干燥24小试，得到粗品 Trp-Asn-Tyr-Thr-His-Val-Asp-Trp-Trp-Pro-Ala-Ala-Cys-Lys-Asp。
切割液选择：1）TFA：H2O=95%：5%、TFA：H2O=97.5%：2.5%
2）TFA：H2O：TIS=95%：2.5%：2.5%
3）三氟乙酸：茴香硫醚：1，2-乙二硫醇：苯酚：水=87.5%：5%：2.5%：2.5%：2.5%
（前两种适合没有容易氧化的氨基酸，例如Trp、Cys、Met。第三种适合几乎所有的序列。）
6、纯化冻干：使用液相色谱纯化，收集目标峰液体，进行冻干，获得蓬松的粉末状固体多肽。不过这时要取小样复测下纯度 是否目标纯度。
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