| 编号: | 407684 |
| 中文名称: | Thr-Arg-Pro-Ile-Ile-Thr-Thr-Ala-pNA |
| 单字母: | H2N-TRPIITTA-pNA |
| 三字母: | H2N N端氨基：N-terminal amino group。在肽或多肽链中含有游离a-氨基的氨基酸一端。在表示氨基酸序列时，通常将N端放在肽链的左边。 -ThrL-苏氨酸：threonine。系统命名为(2S)-氨基-(3R)-羟基丁酸。有两个手性中心，是编码氨基酸。是哺乳动物的必需氨基酸。符号：T，Thr。 -ArgL-精氨酸：arginine。系统命名为(2S)-氨基-5-胍基戊酸。在生理条件下带正电荷，为编码氨基酸。是幼小哺乳动物的必需氨基酸。符号：R，Arg。 -ProL-脯氨酸：proline。系统命名为吡咯烷-(2S)-羧酸。为亚氨基酸。是编码氨基酸。在肽链中有特殊作用，如易形成顺式的肽键等。符号：P，Pro。 -IleL-异亮氨酸：isoleucine。系统命名为(2S)-氨基-(3R)-甲基戊酸。是编码氨基酸。有两个手性碳原子，是哺乳动物的必需氨基酸。符号:I，Ile。 -IleL-异亮氨酸：isoleucine。系统命名为(2S)-氨基-(3R)-甲基戊酸。是编码氨基酸。有两个手性碳原子，是哺乳动物的必需氨基酸。符号:I，Ile。 -ThrL-苏氨酸：threonine。系统命名为(2S)-氨基-(3R)-羟基丁酸。有两个手性中心，是编码氨基酸。是哺乳动物的必需氨基酸。符号：T，Thr。 -ThrL-苏氨酸：threonine。系统命名为(2S)-氨基-(3R)-羟基丁酸。有两个手性中心，是编码氨基酸。是哺乳动物的必需氨基酸。符号：T，Thr。 -Ala丙氨酸：alanine。L-丙氨酸的系统命名为(2S)-氨基丙酸，是编码氨基酸，也叫L-α-丙氨酸。符号：A，Ala。D-丙氨酸存在于多种细菌细胞壁的糖肽中。β-丙氨酸是维生素泛酸和辅酶A的组分。 -pNA对硝基苯胺 |
| 氨基酸个数: | 8 |
| 分子式: | C44H73N13O13 |
| 平均分子量: | 992.13 |
| 精确分子量: | 991.55 |
| 等电点(PI): | - |
| pH=7.0时的净电荷数: | 1.97 |
| 平均亲水性: | -0.32857142857143 |
| 疏水性值: | 0.33 |
| 消光系数: | - |
| 标签: | pNA修饰肽 |
多肽H2N-Thr-Arg-Pro-Ile-Ile-Thr-Thr-Ala-pNA的合成步骤：
1、合成CTC树脂：称取0.35g CTC Resin（如初始取代度约为0.7mmol/g）和0.29mmol Fmoc-Ala-OH于反应器中，加入适量DCM溶解氨基酸（需要注意，此时CTC树脂体积会增大好几倍，避免DCM溶液过少），再加入0.73mmol DIPEA（Mw：129.1,d：0.740g/ml），反应2-3小时后，可不抽滤溶液，直接加入1ml的HPLC级甲醇，封端半小时。依次用DMF洗涤2次，甲醇洗涤1次，DCM洗涤一次，甲醇洗涤一次，DCM洗涤一次，DMF洗涤2次（这里使用甲醇和DCM交替洗涤，是为了更好地去除其他溶质，有利于后续反应）。得到 Fmoc-Ala-CTC Resin。结构图如下：
2、脱Fmoc：加3倍树脂体积的20%Pip/DMF溶液，鼓氮气30分钟，然后2倍树脂体积的DMF 洗涤5次。得到 H2N-Ala-CTC Resin 。（此步骤脱除Fmoc基团，茚三酮检测为蓝色，Pip为哌啶）。结构图如下：
3、缩合：取0.73mmol Fmoc-Thr(tBu)-OH 氨基酸，加入到上述树脂里，加适当DMF溶解氨基酸，再依次加入1.47mmol DIPEA，0.7mmol HBTU。反应30分钟后，取小样洗涤，茚三酮检测为无色。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂。（洗涤树脂，去掉残留溶剂，为下一步反应做准备）。得到Fmoc-Thr(tBu)-Ala-CTC Resin。氨基酸：DIPEA：HBTU：树脂=3：6：2.85：1（摩尔比）。结构图如下：
4、依次循环步骤二、步骤三，依次得到
H2N-Thr(tBu)-Ala-CTC Resin
Fmoc-Thr(tBu)-Thr(tBu)-Ala-CTC Resin
H2N-Thr(tBu)-Thr(tBu)-Ala-CTC Resin
Fmoc-Ile-Thr(tBu)-Thr(tBu)-Ala-CTC Resin
H2N-Ile-Thr(tBu)-Thr(tBu)-Ala-CTC Resin
Fmoc-Ile-Ile-Thr(tBu)-Thr(tBu)-Ala-CTC Resin
H2N-Ile-Ile-Thr(tBu)-Thr(tBu)-Ala-CTC Resin
Fmoc-Pro-Ile-Ile-Thr(tBu)-Thr(tBu)-Ala-CTC Resin
H2N-Pro-Ile-Ile-Thr(tBu)-Thr(tBu)-Ala-CTC Resin
Fmoc-Arg(Pbf)-Pro-Ile-Ile-Thr(tBu)-Thr(tBu)-Ala-CTC Resin
H2N-Arg(Pbf)-Pro-Ile-Ile-Thr(tBu)-Thr(tBu)-Ala-CTC Resin
Fmoc-Thr(tBu)-Arg(Pbf)-Pro-Ile-Ile-Thr(tBu)-Thr(tBu)-Ala-CTC Resin
以上中间结构，均可在专肽生物多肽计算器-多肽结构计算器中，一键画出。
最后再经过步骤二得到 H2N-Thr(tBu)-Arg(Pbf)-Pro-Ile-Ile-Thr(tBu)-Thr(tBu)-Ala-CTC Resin，结构如下：
5、N端临时Boc保护：加适当DMF到树脂中，再依次加入2.94mmol DIPEA，1.47mmol Boc酸酐溶液，鼓氮气反应30分钟。取小样茚三酮检测为无色。Boc酸酐：DIPEA：树脂=6：12：1（摩尔比）。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂（洗涤树脂，去掉残留溶剂，为下一步反应做准备）。 得到 Boc-Thr(tBu)-Arg(Pbf)-Pro-Ile-Ile-Thr(tBu)-Thr(tBu)-Ala-CTC Resin。结构如下：
6、全保护切割：配置0.5%TFA/DCM溶液，溶液体积约为树脂体积的3倍。再次用DCM洗涤树脂2遍（去除残留DMF），后将配置好的溶液倒入到反应器中，反应30分钟。抽滤树脂，收集滤液（此时多肽已经从树脂上分离，存在于滤液中）。多肽序列为 Boc-Thr(tBu)-Arg(Pbf)-Pro-Ile-Ile-Thr(tBu)-Thr(tBu)-Ala-CTC Resin。 在滤液中添加DIEPA，调PH至7-8。用饱和NaHCO3洗涤滤液，分离出DCM层溶液。可适当旋蒸DCM层溶液，减少有机溶剂。再次加入1或2倍体积的乙酸乙酯，用稀HCl溶液调PH至微酸性，将多肽从DCM层萃取到乙酸乙酯层。用饱和NaCl洗涤2次乙酸乙酯层。用无水硫酸镁吸收乙酸乙酯层的水分。通过减压旋蒸，直接将乙酸乙酯完全旋蒸掉，得到晶体状固体多肽，用于下一步C端反应。或通过减压旋蒸保留适量乙酸乙酯的溶液体积，加入冰乙醚析出 多肽，然后对多肽进行烘干操作即可用于下一步C端反应。Boc-Thr(tBu)-Arg(Pbf)-Pro-Ile-Ile-Thr(tBu)-Thr(tBu)-Ala-COOH的结构图如下。
7、4-硝基苯胺反应连接：在上述树脂中，加入适当DMF后，再加入0.73mmol 4-硝基苯胺到树脂中，再加入1.47mmol DIPEA、0.7mmol HBTU，鼓氮气反应30分钟。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂（洗涤树脂，去掉残留溶剂，为下一步反应做准备）。 得到 Boc-Thr(tBu)-Arg(Pbf)-Pro-Ile-Ile-Thr(tBu)-Thr(tBu)-Ala-pNA。 结构如下：
8、切割：6倍树脂体积的切割液（或每1g树脂加8ml左右的切割液），摇床摇晃 2小时，过滤掉树脂，用冰无水乙醚沉淀滤液，并用冰无水乙醚洗涤沉淀物3次，最后将沉淀物放真空干燥釜中，常温干燥24小试，得到粗品H2N-Thr-Arg-Pro-Ile-Ile-Thr-Thr-Ala-pNA。结构图见产品结构图。
切割液选择：1）TFA：H2O=95%：5%
2）TFA：H2O：TIS=95%：2.5%：2.5%
3）三氟乙酸：茴香硫醚：1，2-乙二硫醇：苯酚：水=87.5%：5%：2.5%：2.5%：2.5%
（前两种适合没有容易氧化的氨基酸，例如Trp、Cys、Met。第三种适合几乎所有的序列。）
9、纯化冻干：使用液相色谱纯化，收集目标峰液体，进行冻干，获得蓬松的粉末状固体多肽。不过这时要取小样复测下纯度 是否目标纯度。
10、最后总结：
杭州专肽生物技术有限公司（ALLPEPTIDE https://www.allpeptide.com）主营定制多肽合成业务，提供各类长肽，短肽，环肽，提供各类修饰肽，如：荧光标记修饰（CY3、CY5、CY5.5、CY7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等），功能基团修饰肽（叠氮、炔基、DBCO、DOTA、NOTA等），同位素标记肽（N15、C13），订书肽（Stapled Peptide）,脂肪酸修饰肽（Pal、Myr、Ste），磷酸化修饰肽（P-Ser、P-Thr、P-Tyr），环肽（酰胺键环肽、一对或者多对二硫键环），生物素标记肽，PEG修饰肽，甲基化修饰肽等。
以上所有内容，为专肽生物原创内容，请勿发布到其他网站上。
