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杭州专肽生物的产品

IPSC 消除剂:D-3

D-3 是一种磷酸化肽,是一种高效、简单、特异的 IPSC 消除剂。

编号:637553

CAS号:1967815-98-0

单字母:Nap-fff-DTyr(PO3H2)-OH

纠错
  • 编号:637553
    中文名称:IPSC 消除剂:D-3
    英文名:D-3
    CAS号:1967815-98-0
    单字母:Nap-fff-DTyr(PO3H2)-OH
    三字母:Nap

    2-萘乙酸

    -DPhe

    D型笨丙氨酸

    -DPhe

    D型笨丙氨酸

    -DPhe

    D型笨丙氨酸

    -DTyr(PO3H2)

    D型磷酸化酪氨酸

    -OH

    C端羧基:C-terminal carboxyl group。在肽或多肽链中含有游离羧基的氨基酸一端。在表示氨基酸序列时,通常将C端放在肽链的右边。

    氨基酸个数:4
    分子式:C48H47O10N4P1
    平均分子量:870.88
    精确分子量:870.3
    等电点(PI):-
    pH=7.0时的净电荷数:-
    平均亲水性:-2.5
    疏水性值:2.8
    消光系数:1490
    标签:磷酸化修饰肽    D型氨基酸肽    侧链保护基肽   

  • D-3 是一种磷酸化肽,是一种高效、简单、特异的 IPSC 消除剂。

    D-3, a phosphorpeptide, is an efficient, simple, and specific iPSC-eliminating agent.

    体外研究:
    D-3 在小鼠致瘤性试验中可防止残留 iPSC 诱导的畸胎瘤形成。
    D-3 诱导 201B7 细胞活力明显丧失,半数最大抑制浓度值为 192.3 ± 57.4 μM。
    D-3 诱导激活的 elF2a、p38 和 p44/42 MAPK 数量增加,这些 MAPK 是在细胞应激反应中激活的。D-3 还会增加 Annexin-V 和 SYTOX 阳性细胞的数量,表明 D-3 处理后细胞凋亡和死亡。
    D-3 对各种非 iPSC(包括肝细胞和神经元)影响甚微。

    磷酸肽的合成
    在生命过程中发挥重要作用,磷酸化的位置在多肽上的Tyr、Ser,Thr,。目前磷酸肽合成一般都采用磷酸化氨基酸,目前使用的都是单苄基磷酸化氨基酸。磷酸化氨基酸的连接一般采用HBTU/HOBt/DIEA方法,但是目前采用该方法合成磷酸化多肽也有缺点,特别是在合成多磷酸化多肽或氨基酸较长的多肽的时候,连接效率低,最后产品纯度很低,对于这种磷酸化多肽,我们考虑采用后磷酸化方法,其合成过程就是在多肽合成结束后,选择性脱去要标记的氨基酸的侧链保护基,对于Tyr,Thr可以直接使用侧链不保护的氨基酸进行反应,而Ser可以采用Fmoc-Ser(trt),在1% TFA/DCM条件下可以定量的脱除。后磷酸化,采用双苄基亚磷酰胺,四氮唑生成亚磷酰胺四唑活性中间体,连接到羟基上,随后在过氧酸下氧化生成磷酰基,完成反应。

    目前,多肽的磷酸化修饰方法主要有两种:

    (1)将适当保护的磷酸化氨基酸直接引入到多肽序列中;

    (2)多肽序列在树脂上合成完后,再对其中的Ser、Tyr或Thr的侧链羟基进行磷酸化。
     

    1)将适当保护的磷酸化氨基酸直接引入到多肽序列中:

    即事先将需要磷酸化的氨基酸(Thr,Ser或Tyr)磷酸化并适当保护,然后按照正常SPPS 合成流程将磷酸化单体缩合到多肽指定位点。这种方法操作简便,已经成为多肽单位点 磷酸化修饰的主要方法。



     

    2)多肽序列在树脂上合成完后,再对其中的Ser、Tyr或Thr的侧链羟基进行磷酸化:

            采用将磷酸化单体缩合到多肽中的方法进行磷酸化修饰时,磷酸化的氨基酸由于侧链修 饰的较大基团产生的位阻而导致难以与肽链缩合,并且之后的氨基酸引入都会比较困难, 尤其在含有多个磷酸化位点修饰时,合成将变得异常困难,并且最终产物成分复杂,难 以分离,产率极低。
            因此,当肽链中多个位点进行磷酸化时,可以考虑采用将多肽序列 在树脂上合成完后,再对其中的Ser、Tyr或Thr的侧链羟基进行磷酸化:其合成过程主要 就是在多肽合成结束之后,选择性的脱去要标记氨基酸的侧链保护基,对于Tyr,Thr可 以直接使用侧链不保护的氨基酸进行反应。

            侧链保护基在1%TFA/DCM条件下可以定量的脱 除。采用这种方法时,可以采用双苄基亚磷酰胺,四氮唑生成亚磷酰胺四唑活性中间体, 连接到羟基上,然后在过氧酸条件下氧化生成磷酰基,完成反应。

    磷酸肽的的介绍

    在所有的PTM中,磷酸化是最丰富和最重要的修饰之一。磷酸基团是一个高度带负电的分子,在磷原子周围有一个四面体结构。磷酸化多肽主要指肽链中的Ser、Tyr和Thr 残基的侧链羟基被修饰成酸式磷酸酯多肽。许多激素均是通过提高丝氨酸(Ser)或苏氨酸(Thr)残基的磷酸化状态来调节特异性酶的活性。磷酸化与人类疾病高度相关。例如,tau、α-synuclein和huntingtin的过度/多重磷酸化与人类疾病高度相关,聚集磷酸化也爆发神经退行性疾病的主要原因之一,例如阿尔茨海默氏病、帕金森氏病和亨廷顿氏病。目前,对磷酸化氨基酸的主要研究集中在羟基磷酸单酯型磷酸化氨基酸(O-磷酸化氨基酸),即磷酸化丝氨酸,磷酸化苏氨酸,磷酸化酪氨酸。

    专肽生物生物为客户提供pSer、pTyr、pThr和D-pSer、D-pTyr、D-pThr的磷酸化修饰服务,也可以进行二、三、四、五个磷酸化位点修饰的高质量多肽的合成。

    很多蛋白在细胞中非常容易被降解,或被标记,进而被选择性地破坏。但含有部分D型氨基酸的多肽则显示了很强的抵抗蛋白酶降解能力。

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