迄今为止已描述的最佳人激肽释放酶6(hK6)FRET底物。
编号:128981
CAS号:1926163-28-1
单字母:Abz-AFRFSQ-EDDnp
编号: | 128981 |
中文名称: | 激肽释放酶(KLK)底物, Kallikrein 6 substrate |
CAS号: | 1926163-28-1 |
单字母: | Abz-AFRFSQ-EDDnp |
三字母: | Abz N端Abz修饰 -Ala丙氨酸 -Phe苯丙氨酸 -Arg精氨酸 -Phe苯丙氨酸 -Ser丝氨酸 -Gln谷氨酰胺 -EDDnp暂无说明 |
氨基酸个数: | 6 |
分子式: | C50H63N15O13 |
平均分子量: | 1082.13 |
精确分子量: | 1081.47 |
等电点(PI): | - |
pH=7.0时的净电荷数: | 1 |
平均亲水性: | -0.33333333333333 |
疏水性值: | -0.23 |
消光系数: | - |
来源: | 人工化学合成,仅限科学研究使用,不得用于人体。 |
储存条件: | 负80℃至负20℃ |
标签: | 未分类肽 |
Abz-AFRFSQ-EDDnp, best human kallikrein 6 (hK6) FRET substrate so far described (kcat = 11.6 s⁻¹, Km = 0.3 µM, kcat/Km = 38667 mM⁻¹s⁻¹).
多肽Abz-Ala-Phe-Arg-Phe-Ser-Gln-EDDnp的合成步骤:
1、合成CTC树脂:称取1.49g CTC Resin(如初始取代度约为0.77mmol/g)和1.38mmol Fmoc-Gln(Trt)-OH于反应器中,加入适量DCM溶解氨基酸(需要注意,此时CTC树脂体积会增大好几倍,避免DCM溶液过少),再加入3.44mmol DIPEA(Mw:129.1,d:0.740g/ml),反应2-3小时后,可不抽滤溶液,直接加入1ml的HPLC级甲醇,封端半小时。依次用DMF洗涤2次,甲醇洗涤1次,DCM洗涤一次,甲醇洗涤一次,DCM洗涤一次,DMF洗涤2次(这里使用甲醇和DCM交替洗涤,是为了更好地去除其他溶质,有利于后续反应)。得到 Fmoc-Gln(Trt)-CTC Resin。结构图如下:
2、脱Fmoc:加3倍树脂体积的20%Pip/DMF溶液,鼓氮气30分钟,然后2倍树脂体积的DMF 洗涤5次。得到 H2N-Gln(Trt)-CTC Resin 。(此步骤脱除Fmoc基团,茚三酮检测为蓝色,Pip为哌啶)。结构图如下:
3、缩合:取3.44mmol Fmoc-Ser(tBu)-OH 氨基酸,加入到上述树脂里,加适当DMF溶解氨基酸,再依次加入6.88mmol DIPEA,3.27mmol HBTU。反应30分钟后,取小样洗涤,茚三酮检测为无色。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂。(洗涤树脂,去掉残留溶剂,为下一步反应做准备)。得到Fmoc-Ser(tBu)-Gln(Trt)-CTC Resin。氨基酸:DIPEA:HBTU:树脂=3:6:2.85:1(摩尔比)。结构图如下:
4、依次循环步骤二、步骤三,依次得到
H2N-Ser(tBu)-Gln(Trt)-CTC Resin
Fmoc-Phe-Ser(tBu)-Gln(Trt)-CTC Resin
H2N-Phe-Ser(tBu)-Gln(Trt)-CTC Resin
Fmoc-Arg(Pbf)-Phe-Ser(tBu)-Gln(Trt)-CTC Resin
H2N-Arg(Pbf)-Phe-Ser(tBu)-Gln(Trt)-CTC Resin
Fmoc-Phe-Arg(Pbf)-Phe-Ser(tBu)-Gln(Trt)-CTC Resin
H2N-Phe-Arg(Pbf)-Phe-Ser(tBu)-Gln(Trt)-CTC Resin
Fmoc-Ala-Phe-Arg(Pbf)-Phe-Ser(tBu)-Gln(Trt)-CTC Resin
以上中间结构,均可在专肽生物多肽计算器-多肽结构计算器中,一键画出。
最后再经过步骤二得到 H2N-Ala-Phe-Arg(Pbf)-Phe-Ser(tBu)-Gln(Trt)-CTC Resin,结构如下:
5、邻氨基苯甲酸反应连接:在上述树脂中,加入适当DMF后,再加入3.44mmol邻氨基苯甲酸到树脂中,再加入6.88mmol DIPEA,鼓氮气反应30分钟。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂(洗涤树脂,去掉残留溶剂,为下一步反应做准备)。 得到Abz-Ala-Phe-Arg(Pbf)-Phe-Ser(tBu)-Gln(Trt)-CTC Resin。 结构如下:
6、全保护切割:配置0.5%TFA/DCM溶液,溶液体积约为树脂体积的3倍。再次用DCM洗涤树脂2遍(去除残留DMF),后将配置好的溶液倒入到反应器中,反应30分钟。抽滤树脂,收集滤液(此时多肽已经从树脂上分离,存在于滤液中)。多肽序列为 Abz-Ala-Phe-Arg(Pbf)-Phe-Ser(tBu)-Gln(Trt)-CTC Resin。 在滤液中添加DIEPA,调PH至7-8。用饱和NaHCO3洗涤滤液,分离出DCM层溶液。可适当旋蒸DCM层溶液,减少有机溶剂。再次加入1或2倍体积的乙酸乙酯,用稀HCl溶液调PH至微酸性,将多肽从DCM层萃取到乙酸乙酯层。用饱和NaCl洗涤2次乙酸乙酯层。用无水硫酸镁吸收乙酸乙酯层的水分。通过减压旋蒸,直接将乙酸乙酯完全旋蒸掉,得到晶体状固体多肽,用于下一步C端反应。或通过减压旋蒸保留适量乙酸乙酯的溶液体积,加入冰乙醚析出 多肽,然后对多肽进行烘干操作即可用于下一步C端反应。Abz-Ala-Phe-Arg(Pbf)-Phe-Ser(tBu)-Gln(Trt)-COOH的结构图如下。
7、N1-(2,4-硝基苯基)-1,2-乙二胺反应连接:在上述树脂中,加入适当DMF后,再加入3.44mmol N1-(2,4-硝基苯基)-1,2-乙二胺到树脂中,再加入6.88mmol DIPEA、3.27mmol HBTU,鼓氮气反应30分钟。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂(洗涤树脂,去掉残留溶剂,为下一步反应做准备)。 得到 Abz-Ala-Phe-Arg(Pbf)-Phe-Ser(tBu)-Gln(Trt)-EDDnp。 结构如下:
8、切割:6倍树脂体积的切割液(或每1g树脂加8ml左右的切割液),摇床摇晃 2小时,过滤掉树脂,用冰无水乙醚沉淀滤液,并用冰无水乙醚洗涤沉淀物3次,最后将沉淀物放真空干燥釜中,常温干燥24小试,得到粗品Abz-Ala-Phe-Arg-Phe-Ser-Gln-EDDnp。结构图见产品结构图。
切割液选择:1)TFA:H2O=95%:5%
2)TFA:H2O:TIS=95%:2.5%:2.5%
3)三氟乙酸:茴香硫醚:1,2-乙二硫醇:苯酚:水=87.5%:5%:2.5%:2.5%:2.5%
(前两种适合没有容易氧化的氨基酸,例如Trp、Cys、Met。第三种适合几乎所有的序列。)
9、纯化冻干:使用液相色谱纯化,收集目标峰液体,进行冻干,获得蓬松的粉末状固体多肽。不过这时要取小样复测下纯度 是否目标纯度。
10、最后总结:
杭州专肽生物技术有限公司(ALLPEPTIDE https://www.allpeptide.com)主营定制多肽合成业务,提供各类长肽,短肽,环肽,提供各类修饰肽,如:荧光标记修饰(CY3、CY5、CY5.5、CY7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等),功能基团修饰肽(叠氮、炔基、DBCO、DOTA、NOTA等),同位素标记肽(N15、C13),订书肽(Stapled Peptide),脂肪酸修饰肽(Pal、Myr、Ste),磷酸化修饰肽(P-Ser、P-Thr、P-Tyr),环肽(酰胺键环肽、一对或者多对二硫键环),生物素标记肽,PEG修饰肽,甲基化修饰肽等。
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编号 | 名称 | CAS号 |
426824 | 激肽释放酶(KLK)底物的非标记肽, Kallikrein 6 substrate | |
H2N-AFRFSQK-OH | ||