纤溶酶和微纤溶酶的底物。微纤溶酶水解 D-VLK-pNA 的 Km 为 0.361 +/- 0.017 mM,kcat 为 40.3 +/- 3.3 s⁻¹,而天然纤溶酶的 Km 为 0.355 +/- 0.002 mM,kcat 为 27.9 +/,- 0.3 s⁻¹(50 mM Tris-HCl,pH 7.4,0.1 M NaCl,37 °C)。
编号:129030
CAS号:62354-43-2
单字母:H2N-vLK-pNA
编号: | 129030 |
中文名称: | 标记肽vLK-对硝基苯胺 |
英文名: | H-D-Val-Leu-Lys-pNA |
CAS号: | 62354-43-2 |
单字母: | H2N-vLK-pNA |
三字母: | H2N N端氨基 -DValD型缬氨酸 -Leu亮氨酸 -Lys赖氨酸 -pNA对硝基苯胺 |
氨基酸个数: | 3 |
分子式: | C23H38N6O5 |
平均分子量: | 478.59 |
精确分子量: | 478.29 |
等电点(PI): | - |
pH=7.0时的净电荷数: | 1.97 |
平均亲水性: | -0.1 |
疏水性值: | 1.37 |
消光系数: | - |
来源: | 人工化学合成,仅限科学研究使用,不得用于人体。 |
盐体系: | 可选TFA、HAc、HCl或其它 |
储存条件: | 负80℃至负20℃ |
标签: | pNA修饰肽 D型氨基酸肽 三肽 |
Substrate for plasmin and microplasmin. Microplasmin hydrolyzed D-VLK-pNA with a Km of 0.361 +/- 0.017 mM and a kcat of 40.3 +/- 3.3 s⁻¹, whereas native plasmin had a Km of 0.355 +/- 0.002 mM and a kcat of 27.9 +/- 0.3 s⁻¹ (50 mM Tris-HCl, pH 7.4, 0.1 M NaCl, 37 °C).
很多蛋白在细胞中非常容易被降解,或被标记,进而被选择性地破坏。但含有部分D型氨基酸的多肽则显示了很强的抵抗蛋白酶降解能力。
DOI | 名称 | |
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10.1073/pnas.84.23.8292 | Preparation and purification of microplasmin | 下载 |
10.1021/bi00520a001 | Role of lysine binding regions in the kinetic properties of human plasmin | 下载 |
多肽H2N-DVal-Leu-Lys-pNA的合成步骤:
1、合成CTC树脂:称取0.18g CTC Resin(如初始取代度约为0.97mmol/g)和0.21mmol Fmoc-Lys(Boc)-OH于反应器中,加入适量DCM溶解氨基酸(需要注意,此时CTC树脂体积会增大好几倍,避免DCM溶液过少),再加入0.52mmol DIPEA(Mw:129.1,d:0.740g/ml),反应2-3小时后,可不抽滤溶液,直接加入1ml的HPLC级甲醇,封端半小时。依次用DMF洗涤2次,甲醇洗涤1次,DCM洗涤一次,甲醇洗涤一次,DCM洗涤一次,DMF洗涤2次(这里使用甲醇和DCM交替洗涤,是为了更好地去除其他溶质,有利于后续反应)。得到 Fmoc-Lys(Boc)-CTC Resin。结构图如下:
2、脱Fmoc:加3倍树脂体积的20%Pip/DMF溶液,鼓氮气30分钟,然后2倍树脂体积的DMF 洗涤5次。得到 H2N-Lys(Boc)-CTC Resin 。(此步骤脱除Fmoc基团,茚三酮检测为蓝色,Pip为哌啶)。结构图如下:
3、缩合:取0.52mmol Fmoc-Leu-OH 氨基酸,加入到上述树脂里,加适当DMF溶解氨基酸,再依次加入1.05mmol DIPEA,0.5mmol HBTU。反应30分钟后,取小样洗涤,茚三酮检测为无色。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂。(洗涤树脂,去掉残留溶剂,为下一步反应做准备)。得到Fmoc-Leu-Lys(Boc)-CTC Resin。氨基酸:DIPEA:HBTU:树脂=3:6:2.85:1(摩尔比)。结构图如下:
4、依次循环步骤二、步骤三,依次得到
H2N-Leu-Lys(Boc)-CTC Resin
Fmoc-DVal-Leu-Lys(Boc)-CTC Resin
以上中间结构,均可在专肽生物多肽计算器-多肽结构计算器中,一键画出。
最后再经过步骤二得到 H2N-DVal-Leu-Lys(Boc)-CTC Resin,结构如下:
5、N端临时Boc保护:加适当DMF到树脂中,再依次加入2.1mmol DIPEA,1.05mmol Boc酸酐溶液,鼓氮气反应30分钟。取小样茚三酮检测为无色。Boc酸酐:DIPEA:树脂=6:12:1(摩尔比)。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂(洗涤树脂,去掉残留溶剂,为下一步反应做准备)。 得到 Boc-DVal-Leu-Lys(Boc)-CTC Resin。结构如下:
6、全保护切割:配置0.5%TFA/DCM溶液,溶液体积约为树脂体积的3倍。再次用DCM洗涤树脂2遍(去除残留DMF),后将配置好的溶液倒入到反应器中,反应30分钟。抽滤树脂,收集滤液(此时多肽已经从树脂上分离,存在于滤液中)。多肽序列为 Boc-DVal-Leu-Lys(Boc)-CTC Resin。 在滤液中添加DIEPA,调PH至7-8。用饱和NaHCO3洗涤滤液,分离出DCM层溶液。可适当旋蒸DCM层溶液,减少有机溶剂。再次加入1或2倍体积的乙酸乙酯,用稀HCl溶液调PH至微酸性,将多肽从DCM层萃取到乙酸乙酯层。用饱和NaCl洗涤2次乙酸乙酯层。用无水硫酸镁吸收乙酸乙酯层的水分。通过减压旋蒸,直接将乙酸乙酯完全旋蒸掉,得到晶体状固体多肽,用于下一步C端反应。或通过减压旋蒸保留适量乙酸乙酯的溶液体积,加入冰乙醚析出 多肽,然后对多肽进行烘干操作即可用于下一步C端反应。Boc-DVal-Leu-Lys(Boc)-COOH的结构图如下。
7、4-硝基苯胺反应连接:在上述树脂中,加入适当DMF后,再加入0.52mmol 4-硝基苯胺到树脂中,再加入1.05mmol DIPEA、0.5mmol HBTU,鼓氮气反应30分钟。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂(洗涤树脂,去掉残留溶剂,为下一步反应做准备)。 得到 Boc-DVal-Leu-Lys(Boc)-pNA。 结构如下:
8、切割:6倍树脂体积的切割液(或每1g树脂加8ml左右的切割液),摇床摇晃 2小时,过滤掉树脂,用冰无水乙醚沉淀滤液,并用冰无水乙醚洗涤沉淀物3次,最后将沉淀物放真空干燥釜中,常温干燥24小试,得到粗品H2N-DVal-Leu-Lys-pNA。结构图见产品结构图。
切割液选择:1)TFA:H2O=95%:5%
2)TFA:H2O:TIS=95%:2.5%:2.5%
3)三氟乙酸:茴香硫醚:1,2-乙二硫醇:苯酚:水=87.5%:5%:2.5%:2.5%:2.5%
(前两种适合没有容易氧化的氨基酸,例如Trp、Cys、Met。第三种适合几乎所有的序列。)
9、纯化冻干:使用液相色谱纯化,收集目标峰液体,进行冻干,获得蓬松的粉末状固体多肽。不过这时要取小样复测下纯度 是否目标纯度。
10、最后总结:
杭州专肽生物技术有限公司(ALLPEPTIDE https://www.allpeptide.com)主营定制多肽合成业务,提供各类长肽,短肽,环肽,提供各类修饰肽,如:荧光标记修饰(CY3、CY5、CY5.5、CY7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等),功能基团修饰肽(叠氮、炔基、DBCO、DOTA、NOTA等),同位素标记肽(N15、C13),订书肽(Stapled Peptide),脂肪酸修饰肽(Pal、Myr、Ste),磷酸化修饰肽(P-Ser、P-Thr、P-Tyr),环肽(酰胺键环肽、一对或者多对二硫键环),生物素标记肽,PEG修饰肽,甲基化修饰肽
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