KR-12对应于LL-37的18-29氨基酸残基,是LL-37中保留抗菌活性的最小肽。KR12对细菌有选择性毒性作用,但对人体细胞无选择性毒性作用。它可以作为开发新型蚂蚁的模板。
编号:192385
CAS号:1218951-51-9
单字母:H2N-KRIVQRIKDFLR-CONH2
编号: | 192385 |
中文名称: | KR-12 (human), KR-12 amide (human) |
英文名: | LL-37 (18-29), CAMP (18-29), Antibacterial Protein |
CAS号: | 1218951-51-9 |
单字母: | H2N-KRIVQRIKDFLR-CONH2 |
三字母: | H2N N端氨基 -Lys赖氨酸 -Arg精氨酸 -Ile异亮氨酸 -Val缬氨酸 -Gln谷氨酰胺 -Arg精氨酸 -Ile异亮氨酸 -Lys赖氨酸 -Asp天冬氨酸 -Phe苯丙氨酸 -Leu亮氨酸 -Arg精氨酸 -CONH2C端酰胺化 |
氨基酸个数: | 12 |
分子式: | C71H127N25O15 |
平均分子量: | 1570.93 |
精确分子量: | 1569.99 |
等电点(PI): | 12.82 |
pH=7.0时的净电荷数: | 4.98 |
平均亲水性: | 0.73333333333333 |
疏水性值: | -0.71 |
消光系数: | - |
来源: | 人工化学合成,仅限科学研究使用,不得用于人体。 |
盐体系: | 可选TFA、HAc、HCl或其它 |
储存条件: | 负80℃至负20℃ |
标签: | 未分类肽 |
KR-12 corresponds to amino acid residues 18-29 of LL-37 and is the smallest peptide of LL-37 retaining antibacterial activity. KR12 displays a selective toxic effect on bacteria but not on human cells. It may be used as a template for developing novel antimicrobial agents of therapeutic use.
作为抗菌肽中的一种衍生多肽,KR-12 amide (human)具有相同的序列片段,在序列的改造中,C端加入了酰胺键,通过对C端的封闭使多肽的生理活性发生了改变,在一些研究中表明,KR-12 amide (human)一样具有不错的抗菌效果,且更具特异性,在生物体内的主要作用是,使一些生物过程在无菌干扰的状态进行。
DOI | 名称 | |
---|---|---|
10.1074/jbc.M805533200 | Structures of human host defense cathelicidin LL-37 and its smallest antimicrobial peptide KR-12 in lipid micelles | 下载 |
多肽H2N-Lys-Arg-Ile-Val-Gln-Arg-Ile-Lys-Asp-Phe-Leu-Arg-NH2的合成步骤:
1、合成MBHA树脂:取若干克的MBHA树脂(如初始取代度为0.5mmol/g)和1倍树脂摩尔量的Fmoc-Linker-OH加入到反应器中,加入DMF,搅拌使氨基酸完全溶解。再加入树脂2倍量的DIEPA,搅拌混合均匀。再加入树脂0.95倍量的HBTU,搅拌混合均匀。反应3-4小时后,用DMF洗涤3次。用2倍树脂体积的10%乙酸酐/DMF 进行封端30分钟。然后再用DMF洗涤3次,甲醇洗涤2次,DCM洗涤2次,再用甲醇洗涤2次。真空干燥12小时以上,得到干燥的树脂{Fmoc-Linker-MHBA Resin},测定取代度。这里测得取代度为 0.3mmol/g。结构如下图:
2、脱Fmoc:取2.87g的上述树脂,用DCM或DMF溶胀20分钟。用DMF洗涤2遍。加3倍树脂体积的20%Pip/DMF溶液,鼓氮气30分钟,然后2倍树脂体积的DMF 洗涤5次。得到 H2N-Linker-MBHA Resin 。(此步骤脱除Fmoc基团,茚三酮检测为蓝色,Pip为哌啶)。结构图如下:
3、缩合:取2.58mmol Fmoc-Arg(Pbf)-OH 氨基酸,加入到上述树脂里,加适当DMF溶解氨基酸,再依次加入5.17mmol DIPEA,2.45mmol HBTU。反应30分钟后,取小样洗涤,茚三酮检测为无色。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂。(洗涤树脂,去掉残留溶剂,为下一步反应做准备)。得到Fmoc-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin。氨基酸:DIPEA:HBTU:树脂=3:6:2.85:1(摩尔比)。结构图如下:
4、依次循环步骤二、步骤三,依次得到
H2N-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
H2N-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
H2N-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
H2N-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
H2N-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Ile-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
H2N-Ile-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Arg(Pbf)-Ile-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
H2N-Arg(Pbf)-Ile-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Gln(Trt)-Arg(Pbf)-Ile-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
H2N-Gln(Trt)-Arg(Pbf)-Ile-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Val-Gln(Trt)-Arg(Pbf)-Ile-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
H2N-Val-Gln(Trt)-Arg(Pbf)-Ile-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Ile-Val-Gln(Trt)-Arg(Pbf)-Ile-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
H2N-Ile-Val-Gln(Trt)-Arg(Pbf)-Ile-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Arg(Pbf)-Ile-Val-Gln(Trt)-Arg(Pbf)-Ile-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
H2N-Arg(Pbf)-Ile-Val-Gln(Trt)-Arg(Pbf)-Ile-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
Fmoc-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-Ile-Val-Gln(Trt)-Arg(Pbf)-Ile-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin
以上中间结构,均可在专肽生物多肽计算器-多肽结构计算器中,一键画出。
最后再经过步骤二得到 H2N-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-Ile-Val-Gln(Trt)-Arg(Pbf)-Ile-Lys(Boc)-Asp(OtBu)-Phe-Leu-Arg(Pbf)-Linker-MBHA Resin,结构如下:
5、切割:6倍树脂体积的切割液(或每1g树脂加8ml左右的切割液),摇床摇晃 2小时,过滤掉树脂,用冰无水乙醚沉淀滤液,并用冰无水乙醚洗涤沉淀物3次,最后将沉淀物放真空干燥釜中,常温干燥24小试,得到粗品H2N-Lys-Arg-Ile-Val-Gln-Arg-Ile-Lys-Asp-Phe-Leu-Arg-NH2。结构图见产品结构图。
切割液选择:1)TFA:H2O=95%:5%
2)TFA:H2O:TIS=95%:2.5%:2.5%
3)三氟乙酸:茴香硫醚:1,2-乙二硫醇:苯酚:水=87.5%:5%:2.5%:2.5%:2.5%
(前两种适合没有容易氧化的氨基酸,例如Trp、Cys、Met。第三种适合几乎所有的序列。)
6、纯化冻干:使用液相色谱纯化,收集目标峰液体,进行冻干,获得蓬松的粉末状固体多肽。不过这时要取小样复测下纯度 是否目标纯度。
7、最后总结:
杭州专肽生物技术有限公司(ALLPEPTIDE https://www.allpeptide.com)主营定制多肽合成业务,提供各类长肽,短肽,环肽,提供各类修饰肽,如:荧光标记修饰(CY3、CY5、CY5.5、CY7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等),功能基团修饰肽(叠氮、炔基、DBCO、DOTA、NOTA等),同位素标记肽(N15、C13),订书肽(Stapled Peptide),脂肪酸修饰肽(Pal、Myr、Ste),磷酸化修饰肽(P-Ser、P-Thr、P-Tyr),环肽(酰胺键环肽、一对或者多对二硫键环),生物素标记肽,PEG修饰肽,甲基化修饰肽等。
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