The chromogenic substrate Z-GGL-pNA is used alone or in combination with other substrates as Suc-LLVY-AMC for measuring the chymotrypsin-like activity of the proteasome. Z-GGL-pNA is also cleaved by proteinase yscE (kexin), subtilisins, and neutral endope
编号：182898
CAS号：53046-98-3
单字母：Z-GGL-pNA
| 编号: | 182898 |
| 中文名称: | 三肽蛋白酶体底物：Z-Gly-Gly-Leu-对硝基苯胺 |
| 英文名: | Z-Gly-Gly-Leu-pNA |
| CAS号: | 53046-98-3 |
| 单字母: | Z-GGL-pNA |
| 三字母: | Cbz N端Cbz保护 -Gly甘氨酸 -Gly甘氨酸 -Leu亮氨酸 -pNA对硝基苯胺 |
| 氨基酸个数: | 3 |
| 分子式: | C24H29O7N5 |
| 平均分子量: | 499.52 |
| 精确分子量: | 499.21 |
| 等电点(PI): | - |
| pH=7.0时的净电荷数: | - |
| 平均亲水性: | -1.8 |
| 疏水性值: | 1 |
| 消光系数: | - |
| 来源: | 人工化学合成，仅限科学研究使用，不得用于人体。 |
| 盐体系: | 可选TFA、HAc、HCl或其它 |
| 储存条件: | 负80℃至负20℃ |
| 标签: | pNA修饰肽 CBZ修饰肽 三肽 |
The chromogenic substrate Z-GGL-pNA is used alone or in combination with other substrates as Suc-LLVY-AMC for measuring the chymotrypsin-like activity of the proteasome. Z-GGL-pNA is also cleaved by proteinase yscE (kexin), subtilisins, and neutral endopeptidase 24.5.
| DOI | 名称 | |
|---|---|---|
| 10.1016/j.bbrc.2004.05.098 | Delta12-Prostaglandin J2 inhibits the ubiquitin hydrolase UCH-L1 and elicits ubiquitin-protein aggregation without proteasome inhibition | 下载 |
| 10.1111/j.1471-4159.2004.02456.x | A single amino acid substitution in a proteasome subunit triggers aggregation of ubiquitinated proteins in stressed neuronal cells | 下载 |
| 10.1016/j.jneuroim.2006.07.018 | The role of the proteasome-ubiquitin pathway in regulation of the IFN-gamma mediated anti-VSV response in neurons | 下载 |
| 10.1002/0471140864.ps2106s25 | Purification of the eukaryotic 20S proteasome | 下载 |
| 10.1371/journal.pone.0037921 | Identification and characterisation of a novel acylpeptide hydrolase from Sulfolobus solfataricus: structural and functional insights | 下载 |
| 10.1111/febs.12610 | A novel class of bifunctional acylpeptide hydrolases--potential role in the antioxidant defense systems of the Antarctic fish Trematomus bernacchii | 下载 |
| 10.1042/bj2410129 | A high-molecular-mass neutral endopeptidase-24.5 from human lung | 下载 |
| 10.1248/cpb.33.1721 | New fluorogenic substrates for subtilisin | 下载 |
| 10.1016/s0006-291x(77)80196-4 | Intracellular serine protease from Bacillus subtilis. Structural comparison with extracellular serine proteases-subtilisins | 下载 |
| 10.1016/0003-2697(74)90169-9 | A new chromogenic substrate for subtilisin | 下载 |
| 10.1016/0014-5793(84)80104-0 | Vacuoles are not the sole compartments of proteolytic enzymes in yeast | 下载 |
| 10.1074/jbc.271.28.16455 | The antitumor drug aclacinomycin A, which inhibits the degradation of ubiquitinated proteins, shows selectivity for the chymotrypsin-like activity of the bovine pituitary 20 S proteasome | 下载 |
| 10.1021/je050303e | Systematic Measurements of Peptide Adsorption in Hydrophobic Chromatography | 下载 |
多肽Cbz-Gly-Gly-Leu-pNA的合成步骤：
1、合成CTC树脂：称取1.94g CTC Resin（如初始取代度约为0.94mmol/g）和2.19mmol Fmoc-Leu-OH于反应器中，加入适量DCM溶解氨基酸（需要注意，此时CTC树脂体积会增大好几倍，避免DCM溶液过少），再加入5.47mmol DIPEA（Mw：129.1,d：0.740g/ml），反应2-3小时后，可不抽滤溶液，直接加入1ml的HPLC级甲醇，封端半小时。依次用DMF洗涤2次，甲醇洗涤1次，DCM洗涤一次，甲醇洗涤一次，DCM洗涤一次，DMF洗涤2次（这里使用甲醇和DCM交替洗涤，是为了更好地去除其他溶质，有利于后续反应）。得到 Fmoc-Leu-CTC Resin。结构图如下：
2、脱Fmoc：加3倍树脂体积的20%Pip/DMF溶液，鼓氮气30分钟，然后2倍树脂体积的DMF 洗涤5次。得到 H2N-Leu-CTC Resin 。（此步骤脱除Fmoc基团，茚三酮检测为蓝色，Pip为哌啶）。结构图如下：
3、缩合：取5.47mmol Fmoc-Gly-OH 氨基酸，加入到上述树脂里，加适当DMF溶解氨基酸，再依次加入10.94mmol DIPEA，5.2mmol HBTU。反应30分钟后，取小样洗涤，茚三酮检测为无色。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂。（洗涤树脂，去掉残留溶剂，为下一步反应做准备）。得到Fmoc-Gly-Leu-CTC Resin。氨基酸：DIPEA：HBTU：树脂=3：6：2.85：1（摩尔比）。结构图如下：
4、依次循环步骤二、步骤三，依次得到
H2N-Gly-Leu-CTC Resin
Fmoc-Gly-Gly-Leu-CTC Resin
以上中间结构，均可在专肽生物多肽计算器-多肽结构计算器中，一键画出。
最后再经过步骤二得到 H2N-Gly-Gly-Leu-CTC Resin，结构如下：
5、苯甲氧羰酰琥珀酰亚胺Cbz-Cl反应连接：在上述树脂中，加入适当DMF后，再加入5.47mmol 苯甲氧羰酰琥珀酰亚胺Cbz-Cl到树脂中，再加入10.94mmol DIPEA、5.2mmol HBTU，鼓氮气反应30分钟。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂（洗涤树脂，去掉残留溶剂，为下一步反应做准备）。 得到Cbz-Gly-Gly-Leu-CTC Resin。 结构如下：
6、全保护切割：配置0.5%TFA/DCM溶液，溶液体积约为树脂体积的3倍。再次用DCM洗涤树脂2遍（去除残留DMF），后将配置好的溶液倒入到反应器中，反应30分钟。抽滤树脂，收集滤液（此时多肽已经从树脂上分离，存在于滤液中）。多肽序列为 Cbz-Gly-Gly-Leu-CTC Resin。 在滤液中添加DIEPA，调PH至7-8。用饱和NaHCO3洗涤滤液，分离出DCM层溶液。可适当旋蒸DCM层溶液，减少有机溶剂。再次加入1或2倍体积的乙酸乙酯，用稀HCl溶液调PH至微酸性，将多肽从DCM层萃取到乙酸乙酯层。用饱和NaCl洗涤2次乙酸乙酯层。用无水硫酸镁吸收乙酸乙酯层的水分。通过减压旋蒸，直接将乙酸乙酯完全旋蒸掉，得到晶体状固体多肽，用于下一步C端反应。或通过减压旋蒸保留适量乙酸乙酯的溶液体积，加入冰乙醚析出 多肽，然后对多肽进行烘干操作即可用于下一步C端反应。Cbz-Gly-Gly-Leu-COOH的结构图如下。
7、4-硝基苯胺反应连接：在上述树脂中，加入适当DMF后，再加入5.47mmol 4-硝基苯胺到树脂中，再加入10.94mmol DIPEA、5.2mmol HBTU，鼓氮气反应30分钟。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂（洗涤树脂，去掉残留溶剂，为下一步反应做准备）。 得到 Cbz-Gly-Gly-Leu-pNA。 结构如下：
8、切割：6倍树脂体积的切割液（或每1g树脂加8ml左右的切割液），摇床摇晃 2小时，过滤掉树脂，用冰无水乙醚沉淀滤液，并用冰无水乙醚洗涤沉淀物3次，最后将沉淀物放真空干燥釜中，常温干燥24小试，得到粗品Cbz-Gly-Gly-Leu-pNA。结构图见产品结构图。
切割液选择：1）TFA：H2O=95%：5%
2）TFA：H2O：TIS=95%：2.5%：2.5%
3）三氟乙酸：茴香硫醚：1，2-乙二硫醇：苯酚：水=87.5%：5%：2.5%：2.5%：2.5%
（前两种适合没有容易氧化的氨基酸，例如Trp、Cys、Met。第三种适合几乎所有的序列。）
9、纯化冻干：使用液相色谱纯化，收集目标峰液体，进行冻干，获得蓬松的粉末状固体多肽。不过这时要取小样复测下纯度 是否目标纯度。
10、最后总结：
杭州专肽生物技术有限公司（ALLPEPTIDE https://www.allpeptide.com）主营定制多肽合成业务，提供各类长肽，短肽，环肽，提供各类修饰肽，如：荧光标记修饰（CY3、CY5、CY5.5、CY7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等），功能基团修饰肽（叠氮、炔基、DBCO、DOTA、NOTA等），同位素标记肽（N15、C13），订书肽（Stapled Peptide）,脂肪酸修饰肽（Pal、Myr、Ste），磷酸化修饰肽（P-Ser、P-Thr、P-Tyr），环肽（酰胺键环肽、一对或者多对二硫键环），生物素标记肽，PEG修饰肽，甲基化修饰肽等。
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