近日,RNA领域权威期刊RNA以“The S. pombe mitochondrial transcriptome”为题在线发表了的生命科学学院黄鹰教授课题组关于裂殖酵母线粒体转录组的最新研究进展。RNA杂志由冷泉港出版社出版发行,是RNA领域的经典旗舰期刊。
线粒体是真核生物生产能量的细胞器,通过氧化磷酸化合成ATP。此外,线粒体参与许多重要的细胞过程,包括氨基酸和脂肪酸合成,活性氧物质产生,细胞凋亡和衰老。线粒体功能障碍与许多重要疾病相关,其中包括癌症,神经退行性疾病,线粒体遗传性疾病以及和代谢紊乱疾病如糖尿病有关。粟酒裂殖酵母作为一种简单的真核模式生物,其与哺乳动物细胞的呼吸生理及线粒体基因组组成方面都极具相似性。因此粟酒裂殖酵母是一个很有潜力的线粒体研究模型。
该论文主要分析了裂殖酵母线粒体基因表达以及转录后过程控制,包括线粒体RNA(mt-RNA)加工,修饰,衰变和质量控制。缺陷的线粒体基因表达导致线粒体氧化磷酸化缺乏并且已经涉及多种人类疾病。为了完全了解线粒体转录和RNA加工,我们对来自裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)的mt-RNA进行了RNA-seq分析。RNA-seq分析表明,mt-RNA的丰度差异很大。数据分析还揭示了mt-RNA精确加工位点,包括线粒体tRNA(mt-tRNA)5'-末端加工酶RNase P的非典型的RNA切割。此外,该论文研究揭示了先前未知的线粒体转录物,包括tRNA 5'-末端加工酶RNase P RNA成分衍生的片段;线粒体小RNA(mitosRNA),例如mt-tRNA衍生的片段(mt-tRF)和mt-tRNA半分子;以及在粟酒裂殖酵母中用3'-CCACCA / CCACC标记的mt-tRNA。最后,RNA-seq揭示了编码粟酒裂殖酵母线粒体tRNA 3'末端加工酶的trz2失活导致mt-tRNA 3'末端加工全局性损害;抑制mt-mRNA 5'-末端加工并导致未加工转录产物的积累;证明使用RNA-seq检测已知或预测参与粟酒裂殖酵母中mt-RNA加工的蛋白质的可行性。我们的工作揭示了真菌线粒体转录组的复杂性,并为使用S. pombe作为线粒体研究模型提供了框架。
相关研究发表在RNA学领域权威杂志RNA上(文章链接:http://rnajournal.cshlp.org/content/early/2018/06/28/rna.064477.117.abst...),商巾杰副教授为第一作者,黄鹰教授为通讯作者,相关研究受到国家自然科学基金、江苏省优势学科建设项目等的支持。
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